RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580515.5

TSPOAP1-AS1-206, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 980 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CDHR1Q96JP9 859 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.67■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PARNO95453 639 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CKBP12277 381 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ITGB5P18084 799 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HIC1Q14526 733 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GPNMBQ14956 572 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 Q6ZUG5 572 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 LRRC8DQ7L1W4 858 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCN5AQ14524 2016 aa27.66■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FOSL2P15408 326 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 HOXC8P31273 242 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NAPAP54920 295 aa27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 STXBP3O00186 592 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCNA2P16389 499 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADD1P35611 737 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 APOBRQ0VD83 1088 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BRF1Q92994 677 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EHMT1Q9H9B1 1298 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BARHL2Q9NY43 387 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.64■■■□□ 2.02
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.64■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MAFGO15525 162 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATP9AO75110 1047 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RPS6KB1P23443 525 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SERINC5Q86VE9 423 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 WNT8BQ93098 351 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TELO2Q9Y4R8 837 aa27.63■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NID2Q14112 1375 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 BAIAP3O94812 1187 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 FOSP01100 380 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CXCL10P02778 98 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PSMA5P28066 241 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RABGGTBP53611 331 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MTMR1Q13613 665 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRAF7Q6Q0C0 670 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SLC9A7Q96T83 725 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 RNPEPQ9H4A4 650 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 JADE2Q9NQC1 790 aa27.62■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SMCO2A6NFE2 343 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 NBNO60934 754 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADCY7P51828 1080 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GLT8D2Q9H1C3 349 aa27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SP4Q02446 784 aa27.6■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ZNF618Q5T7W0 954 aa27.6■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRIM50Q86XT4 487 aa27.6■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ATP6V0A1Q93050 837 aa27.6■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EYSQ5T1H1 3165 aa27.59■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CNKSR3Q6P9H4 555 aa27.59■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 DOCK5Q9H7D0 1870 aa27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MYOGP15173 224 aa27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 AP3B2Q13367 1082 aa27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ANO3Q9BYT9 981 aa27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRDM12Q9H4Q4 367 aa27.58■■■□□ 2.01
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GBF1Q92538 1859 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 TREHO43280 583 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GNAT1P11488 350 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SCG2P13521 617 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 EVCP57679 992 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 MBTPS1Q14703 1052 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PGBD1Q96JS3 809 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 SETD4Q9NVD3 440 aa27.57■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 A0A0C4DFX4 3053 aa27.56■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 THPOP40225 353 aa27.56■■■□□ 2
TSPOAP1-AS1-206ENST00000580515 ADAM17P78536 824 aa27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms