RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573324.1

SALL3-204, Transcript of spalt like transcription factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene SALL3, Length 838 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3-204ENST00000573324 SPDYE3A6NKU9 549 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 RFC2P35250 354 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 GPNMBQ14956 572 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 NLRX1Q86UT6 975 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 TRIM50Q86XT4 487 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 RETREG2Q8NC44 543 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 CAGE1Q8TC20 777 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 GPRASP2Q96D09 838 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 CHD7Q9P2D1 2997 aa25.23■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 NOP56O00567 594 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 ATP9AO75110 1047 aa25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 KCNA2P16389 499 aa25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 CCDC155Q8N6L0 562 aa25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 MYLIPQ8WY64 445 aa25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 PGBD1Q96JS3 809 aa25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 BARHL2Q9NY43 387 aa25.22■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.21■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 HOXC8P31273 242 aa25.21■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 ADCY7P51828 1080 aa25.21■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 SP4Q02446 784 aa25.21■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.21■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 UNC80Q8N2C7 3258 aa25.2■■□□□ 1.63
SALL3-204ENST00000573324 ZBBXA8MT70 800 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 H3BRB1 525 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SELPP16109 830 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PTK7Q13308 1070 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 GRIN2CQ14957 1233 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 LRRC8DQ7L1W4 858 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 USP26Q9BXU7 913 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PTPRSQ13332 1948 aa25.2■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 A0A0C4DFX4 3053 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 CKBP12277 381 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PSMA5P28066 241 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ANO3Q9BYT9 981 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ZNF576Q9H609 170 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 JADE2Q9NQC1 790 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 TMEM260Q9NX78 707 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.19■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SMCO2A6NFE2 343 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ADAMTS3O15072 1205 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 CLK2P49760 499 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 MTMR1Q13613 665 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SERINC5Q86VE9 423 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 TEX2Q8IWB9 1127 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 CDHR1Q96JP9 859 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.18■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 NBNO60934 754 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SCG2P13521 617 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 RABGGTBP53611 331 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 EVCP57679 992 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 MBTPS1Q14703 1052 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 RAB30Q15771 203 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 NTRK3Q16288 839 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PKN1Q16512 942 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 TCTN1Q2MV58 587 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 RUFY3Q7L099 469 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 EHMT1Q9H9B1 1298 aa25.17■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 C17orf102A2RUQ5 167 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PPFIA3O75145 1194 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ACTN1P12814 892 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 MYO9BQ13459 2157 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ZNF618Q5T7W0 954 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PHKBQ93100 1093 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.16■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 FOSP01100 380 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 CXCL10P02778 98 aa25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 MYOGP15173 224 aa25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SREBF1P36956 1147 aa25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 AP3B2Q13367 1082 aa25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 SLC17A8Q8NDX2 589 aa25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 MXRA8Q9BRK3 442 aa25.15■■□□□ 1.62
SALL3-204ENST00000573324 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms