RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	BANK1	Q8NDB2	785 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	TOP1MT	Q969P6	601 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	MTMR8	Q96EF0	704 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	TECTA	O75443	2155 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169		H3BRB1	525 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	SORBS3	O60504	671 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	GPM6B	Q13491	265 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	PGM5	Q15124	567 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	IL31RA	Q8NI17	732 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	SEPT8	Q92599	483 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	YME1L1	Q96TA2	773 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	TREH	O43280	583 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	CAND2	O75155	1236 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	RILPL2	Q969X0	211 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	KLRF2	D3W0D1	207 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB5	O15062	677 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	DCX	O43602	365 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	LGALS2	P05162	132 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	ZP2	Q05996	745 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	FAM50B	Q9Y247	325 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.22	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	UPP2	O95045	317 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	CCND2	P30279	289 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	LTBR	P36941	435 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	SEC23A	Q15436	765 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	APBB2	Q92870	758 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	KRT23	Q9C075	422 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	LNPK	Q9C0E8	428 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		13.21	□□□□□ -0.29
TCF4-238	ENST00000568169	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	NCK2	O43639	380 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CTSH	P09668	335 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	LINC00271	P0C7V0	271 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	GNAT1	P11488	350 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ICAM3	P32942	547 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ADAM17	P78536	824 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SETD4	Q9NVD3	440 aa		13.2	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	RB1	P06400	928 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	MRE11	P49959	708 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	NHLH1	Q02575	133 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	TRAF1	Q13077	416 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	METTL7B	Q6UX53	244 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	FIBCD1	Q8N539	461 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	IL17RA	Q96F46	866 aa		13.19	□□□□□ -0.3
TCF4-238	ENST00000568169	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.19	□□□□□ -0.3

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