RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 THEGQ9P2T0 379 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTUS1Q9ULD2 1270 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.26□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BRB1 525 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 MEIS2O14770 477 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TREHO43280 583 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 FIBPO43427 364 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPFIA4O75335 1185 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAIAP3O94812 1187 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 GNAQP50148 359 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAP1Q03518 808 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 MBTPS1Q14703 1052 aa8.25□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNKSR3Q6P9H4 555 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPR20Q99678 358 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 SETD4Q9NVD3 440 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.25□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC28Q96AY4 2481 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPDYE3A6NKU9 549 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA8AA7E2F4 631 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF28PB7ZC32 967 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC45O75419 566 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 LGR5O75473 907 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXCL10P02778 98 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALM1P0DP23 149 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALM2P0DP24 149 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CALM3P0DP25 149 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TGFB3P10600 412 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPA1P15085 419 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 MARK3P27448 753 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 ICAM3P32942 547 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIFRP42702 1097 aa8.24□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP4P98171 946 aa8.24□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP3K14Q99558 947 aa8.24□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.24□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.23□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP9AO75110 1047 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPFIA3O75145 1194 aa8.23□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGB5P18084 799 aa8.23□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RTN1Q16799 776 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL27Q8NEV9 243 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.23□□□□□ -1.09
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CCNDBP1-212ENST00000567690 UIMC1Q96RL1 719 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTA3Q9BTC8 594 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 USP26Q9BXU7 913 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHA6Q9UN73 950 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTCH2Q9Y6C9 303 aa8.23□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.22□□□□□ -1.09
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