RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566243.5

EDC3-211, Transcript of enhancer of mRNA decapping 3, humanhuman

TSL 3

Gene EDC3, Length 711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3-211ENST00000566243 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 EPHB4P54760 987 aa21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 TDHQ8IZJ6 230 aa21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 GTF3C6Q969F1 213 aa21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 UMODL1Q5DID0 1318 aa21.78■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 ARP10275 920 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CYP2C9P11712 490 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 NLRP5P59047 1200 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 SP4Q02446 784 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 MFSD10Q14728 455 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 CEP55Q53EZ4 464 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 BICD2Q8TD16 824 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 ALG1Q9BT22 464 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 KCNH7Q9NS40 1196 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 LTBP2Q14767 1821 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.77■■□□□ 1.08
EDC3-211ENST00000566243 STK36Q9NRP7 1315 aa21.77■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 FAM86B1E9PN63 330 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 MEIS1O00470 390 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 MAFGO15525 162 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 CYP2C18P33260 490 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 ST3GAL1Q11201 340 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 NPY5RQ15761 445 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 MCTP2Q6DN12 878 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 MFSD5Q6N075 450 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 SESTD1Q86VW0 696 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 CTAGE1Q96RT6 745 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 HIPK3Q9H422 1215 aa21.76■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 LGALS2P05162 132 aa21.75■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 CYP3A4P08684 503 aa21.75■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.75■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 FPGSQ05932 587 aa21.75■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.75■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.75■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 EDIL3O43854 480 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 ZNF76P36508 570 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 SHHQ15465 462 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 TRIM50Q86XT4 487 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 C7orf31Q8N865 590 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 WNT8AQ9H1J5 351 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.74■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 M0R2N6 131 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 CSF2RAP15509 400 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 CCL23P55773 120 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 HIC1Q14526 733 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 PTGISQ16647 500 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 H3BRB1 525 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 JAK2O60674 1132 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 BLIDQ8IZY5 108 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 TMEM199Q8N511 208 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.72■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 CIITAP33076 1130 aa21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 UIMC1Q96RL1 719 aa21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 NOD1Q9Y239 953 aa21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 NFASCO94856 1347 aa21.71■■□□□ 1.07
EDC3-211ENST00000566243 SZT2Q5T011 3432 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 GALNT17Q6IS24 598 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 LENG9Q96B70 501 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 SCLYQ96I15 445 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 LRCH3Q96II8 777 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 SDF4Q9BRK5 362 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.7■■□□□ 1.06
EDC3-211ENST00000566243 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
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