RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.68■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 BFSP2Q13515 415 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 PTGISQ16647 500 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 ALG1Q9BT22 464 aa22.67■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 H3BRB1 525 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 PITPNM1O00562 1244 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 LGALS2P05162 132 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CYP2C9P11712 490 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CSF2RAP15509 400 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 KCNA2P16389 499 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF76P36508 570 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CEP55Q53EZ4 464 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 CAGE1Q8TC20 777 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 PGBD1Q96JS3 809 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 GPR20Q99678 358 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 IL23AQ9NPF7 189 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM260Q9NX78 707 aa22.66■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 AK2P54819 239 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 ARHGAP4P98171 946 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 RETREG2Q8NC44 543 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 SCN5AQ14524 2016 aa22.65■■□□□ 1.22
CMTM3-211ENST00000565922 PFKFB2O60825 505 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 PPFIA3O75145 1194 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 PFKMP08237 780 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 EPHB4P54760 987 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 NLRP5P59047 1200 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SP4Q02446 784 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SCRN1Q12765 414 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 LRCH3Q96II8 777 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SDF4Q9BRK5 362 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.64■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 NFASCO94856 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 STK36Q9NRP7 1315 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 ATP9AO75110 1047 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SEC24BO95487 1268 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 CYP3A4P08684 503 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 XBP1P17861 261 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 RFC2P35250 354 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 NEK4P51957 841 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 CCL23P55773 120 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 GALNT17Q6IS24 598 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 MEIS1O00470 390 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 C8orf34Q49A92 452 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.212e-6■■□□□ 14.2
CMTM3-211ENST00000565922 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 LAMA3Q16787 3333 aa22.62■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 GNAT1P11488 350 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 PTK7Q13308 1070 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM240Q5SV17 173 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 RBL2Q08999 1139 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 WASF1Q92558 559 aa22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 FGBP02675 491 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 IQCF3P0C7M6 154 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 ARP10275 920 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 ACRP10323 421 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF365Q70YC5 407 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SCLYQ96I15 445 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 ERAP1Q9NZ08 941 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.59■■□□□ 1.21
CMTM3-211ENST00000565922 WDR81Q562E7 1941 aa22.59■■□□□ 1.21
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