RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR20	Q99678	358 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	BARHL2	Q9NY43	387 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		24.99	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		24.98	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RFC2	P35250	354 aa		24.98	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NAPA	P54920	295 aa		24.98	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	EVC	P57679	992 aa		24.98	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	HIC1	Q14526	733 aa		24.98	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRX1	Q86UT6	975 aa		24.98	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		24.98	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		24.97	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS2	P05162	132 aa		24.97	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RETREG2	Q8NC44	543 aa		24.97	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PBX4	Q9BYU1	374 aa		24.97	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	24.97	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	24.97	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GBF1	Q92538	1859 aa		24.97	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BRB1	525 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP9A	O75110	1047 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNA2	P16389	499 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC8	P31273	242 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PBX2	P40425	430 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO9B	Q13459	2157 aa		24.96	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GPNMB	Q14956	572 aa		24.95	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	RUFY3	Q7L099	469 aa		24.95	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CDHR1	Q96JP9	859 aa		24.95	■■□□□ 1.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SMCO2	A6NFE2	343 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ADCY7	P51828	1080 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PTK7	Q13308	1070 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	NTRK3	Q16288	839 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	WNT8B	Q93098	351 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	JADE2	Q9NQC1	790 aa		24.95	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	MAFG	O15525	162 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	24.94	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CKB	P12277	381 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SELP	P16109	830 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	MTMR1	Q13613	665 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PKN1	Q16512	942 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TIFA	Q96CG3	184 aa		24.94	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SCG2	P13521	617 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	VCAN	P13611	3396 aa		24.93	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	AP3B2	Q13367	1082 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SERINC5	Q86VE9	423 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM50	Q86XT4	487 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PGBD1	Q96JS3	809 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ANO3	Q9BYT9	981 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF576	Q9H609	170 aa		24.92	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ESYT2	A0FGR8	921 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIN2C	Q14957	1233 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM260	Q9NX78	707 aa		24.91	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TRANK1	O15050	2925 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCL10	P02778	98 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SREBF1	P36956	1147 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SP4	Q02446	784 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB30	Q15771	203 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PHKB	Q93100	1093 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		24.9	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBBX	A8MT70	800 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTS3	O15072	1205 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	NBN	O60934	754 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTN1	P12814	892 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNAR1	P17181	557 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	MYLIP	Q8WY64	445 aa		24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	24.89	■■□□□ 1.58	2e-10	■■■□□ 16.7

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms