RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-208ENST00000559642 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.75□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.75□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 HDAC6Q9UBN7 1215 aa14.75□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.75□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 HAS3O00219 553 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 PPFIA4O75335 1185 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SREBF1P36956 1147 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SCRN1Q12765 414 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.052e-9■■■□□ 14.7
BMP4-208ENST00000559642 PTGISQ16647 500 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SESTD1Q86VW0 696 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 TRIM22Q8IYM9 498 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 C7orf31Q8N865 590 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 IL17RAQ96F46 866 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 AIFM3Q96NN9 605 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 11.8
BMP4-208ENST00000559642 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 C6orf50Q9HD87 102 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 JADE2Q9NQC1 790 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 NOD1Q9Y239 953 aa14.74□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 LARGE1O95461 756 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 ARHGAP4P98171 946 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 HIC1Q14526 733 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 CDHR1Q96JP9 859 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SZT2Q5T011 3432 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 PFKFB2O60825 505 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 ARP10275 920 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 CEP55Q53EZ4 464 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 TMEM240Q5SV17 173 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 ZNF365Q70YC5 407 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 Q7L0L9 218 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 UIMC1Q96RL1 719 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 IL23AQ9NPF7 189 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 KCNH7Q9NS40 1196 aa14.72□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 H3BRB1 525 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 DEXIO95424 95 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 GNA11P29992 359 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 ZNF76P36508 570 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 NLRP5P59047 1200 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 NECAB1Q8N987 351 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 WNT8BQ93098 351 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 VWCEQ96DN2 955 aa14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
BMP4-208ENST00000559642 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FAM86B1E9PN63 330 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CTDNEP1O95476 244 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 NEK4P51957 841 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ANKRD1Q15327 319 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ME3Q16798 604 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 DEFB128Q7Z7B8 93 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 BICD2Q8TD16 824 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SH3GLB2Q9NR46 395 aa14.7□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 GBF1Q92538 1859 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 STK36Q9NRP7 1315 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 MEIS1O00470 390 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PITPNM1O00562 1244 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CDKL5O76039 1030 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 CYP3A4P08684 503 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 MARK3P27448 753 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 BFSP2Q13515 415 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 RETREG2Q8NC44 543 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SDF4Q9BRK5 362 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
BMP4-208ENST00000559642 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms