RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, human

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNX1-206	ENST00000554292	PSMC6	P62333	389 aa		32.34	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	CLTB	P09497	229 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	USP11	P51784	963 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	32.33	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	SDF4	Q9BRK5	362 aa		32.33	■■■□□ 2.77
PCNX1-206	ENST00000554292	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	CIITA	P33076	1130 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	TBCK	Q8TEA7	893 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		32.32	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	NFASC	O94856	1347 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM86B1	E9PN63	330 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	ATP9A	O75110	1047 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	KRT2	P35908	639 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	TMX3	Q96JJ7	454 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		32.31	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	GRIN2D	O15399	1336 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	F2	P00734	622 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	AR	P10275	920 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	SYN1	P17600	705 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	GPR20	Q99678	358 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	KIF3A	Q9Y496	699 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF286B	P0CG31	522 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	SP4	Q02446	784 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		32.29	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	LTBP2	Q14767	1821 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	MMP1	P03956	469 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	PSEN2	P49810	448 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	PRR16	Q569H4	304 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	KRT40	Q6A162	431 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	KAT2B	Q92831	832 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	C8orf76	Q96K31	380 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		32.28	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	LGALS2	P05162	132 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	CHMP4BP1	P59074	171 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	FAAP100	Q0VG06	881 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
PCNX1-206	ENST00000554292	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	FOSB	P53539	338 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	MFSD10	Q14728	455 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		32.26	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	KIAA0355	O15063	1070 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	CD4	P01730	458 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	INF2	Q27J81	1249 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	SESTD1	Q86VW0	696 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	OXER1	Q8TDS5	423 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		32.25	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	KAT6A	Q92794	2004 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292		H3BRB1	525 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	HAS3	O00219	553 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	NEK8	Q86SG6	692 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	C7orf31	Q8N865	590 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	TBX21	Q9UL17	535 aa		32.24	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	B4GALT4	O60513	344 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	RAG1	P15918	1043 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		32.23	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	CYP3A7	P24462	503 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292		Q4G0T1	1027 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	LENG9	Q96B70	501 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	NOD1	Q9Y239	953 aa		32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	NR5A1	Q13285	461 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PCNX1-206	ENST00000554292	LETM2	Q2VYF4	491 aa		32.21	■■■□□ 2.75

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