RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	LOC101059915	A0A1B0GWI6	518 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	SH3D21	A4FU49	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	SLC27A2	O14975	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	KCNQ2	O43526	872 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	EFCAB14	O75071	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	LRG1	P02750	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	ITGA1	P56199	1179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	NKX3-2	P78367	333 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	TUSC3	Q13454	348 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	SQSTM1	Q13501	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	KCNC2	Q96PR1	638 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	DSE	Q9UL01	958 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MDM2-233	ENST00000545204	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RASGRP1	O95267	797 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	LTF	P02788	710 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	BMP7	P18075	431 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	THBS2	P35442	1172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	EPHA5	P54756	1037 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	LIPI	Q6XZB0	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	KY	Q8NBH2	561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SCLY	Q96I15	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204		A0A1B0GTL3	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PLD2	O14939	933 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SLURP1	P55000	103 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	GRIN1	Q05586	938 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ADAM9	Q13443	819 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	KCTD1	Q719H9	257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	BRAP	Q7Z569	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CD244	Q9BZW8	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM260	Q9NX78	707 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	NTM	Q9P121	344 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	WASF3	Q9UPY6	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	GSTA4	O15217	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	AMY2A	P04746	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CKM	P06732	381 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	INHBB	P09529	407 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PYGM	P11217	842 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PDE6A	P16499	860 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	FAH	P16930	419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	AMY2B	P19961	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ST5	P78524	1137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	GPR19	Q15760	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CARF	Q8N187	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	MAN2B1	O00754	1011 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	SASH1	O94885	1247 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	DNM2	P50570	870 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	JAM2	P57087	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	CRY1	Q16526	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM2-233	ENST00000545204	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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