RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 NTRK3Q16288 839 aa28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM240Q5SV17 173 aa28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 CAGE1Q8TC20 777 aa28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 JADE2Q9NQC1 790 aa28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.57■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 LGALS2P05162 132 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 PFKMP08237 780 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ITGB5P18084 799 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 GNA11P29992 359 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 DEFB123Q8N688 67 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 GPR20Q99678 358 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 DOCK5Q9H7D0 1870 aa28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 TANC1Q9C0D5 1861 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 H3BRB1 525 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ACRP10323 421 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 RFC2P35250 354 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 CLK2P49760 499 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 PKN1Q16512 942 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF365Q70YC5 407 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 BICD2Q8TD16 824 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 PGBD1Q96JS3 809 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 FGBP02675 491 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNA2P16389 499 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 SREBF1P36956 1147 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 SP4Q02446 784 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 SCLYQ96I15 445 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 MXRA8Q9BRK3 442 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.54■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.53■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM260Q9NX78 707 aa28.53■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF76P36508 570 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ANKRD1Q15327 319 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 CEP55Q53EZ4 464 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 HERVK_113Q902F9 699 aa28.52■■■□□ 2.16
TM7SF3-212ENST00000543088 ATP9AO75110 1047 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGAP4P98171 946 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 STK3Q13188 491 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 PTK7Q13308 1070 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SDF4Q9BRK5 362 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.51■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 CDKL5O76039 1030 aa28.5■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 DEXIO95424 95 aa28.5■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 RASIP1Q5U651 963 aa28.5■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 Q7L0L9 218 aa28.5■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 PPFIA3O75145 1194 aa28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 PARNO95453 639 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 IQCF3P0C7M6 154 aa28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 RBL2Q08999 1139 aa28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 GNAT1P11488 350 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 ACTN1P12814 892 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SELPP16109 830 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 OTOP2Q7RTS6 562 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 VPS54Q9P1Q0 977 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC9A2Q9UBY0 812 aa28.48■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 NFASCO94856 1347 aa28.47■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM265A0A087WTH1 108 aa28.47■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC8DQ7L1W4 858 aa28.47■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIM50Q86XT4 487 aa28.47■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 IL17RAQ96F46 866 aa28.47■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 MEIS1O00470 390 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 CYP3A4P08684 503 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 NLRP5P59047 1200 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 CYP2W1Q8TAV3 490 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.46■■■□□ 2.159e-6■□□□□ 10.5
TM7SF3-212ENST00000543088 MTMR10Q9NXD2 777 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 SCN5AQ14524 2016 aa28.46■■■□□ 2.15
TM7SF3-212ENST00000543088 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms