RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531474.2

NXF1-209, Transcript of nuclear RNA export factor 1, human

TSL 3

Gene NXF1, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NXF1-209	ENST00000531474	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	LCT	P09848	1927 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ADCY5	O95622	1261 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	CYBA	P13498	195 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	CNGA1	P29973	690 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	SREBF1	P36956	1147 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ARHGAP4	P98171	946 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ACVR2B	Q13705	512 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	TRPV1	Q8NER1	839 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ARMC5	Q96C12	935 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	CBX8	Q9HC52	389 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	FAM205C	A6NFA0	338 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474		M0R2N6	131 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	LAD1	O00515	517 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	CCL5	P13501	91 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ZNF76	P36508	570 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	NLRP12	P59046	1061 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	MTFR1	Q15390	333 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	INF2	Q27J81	1249 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	TTC38	Q5R3I4	469 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	SHC4	Q6S5L8	630 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	TBCK	Q8TEA7	893 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	TNFRSF25	Q93038	417 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	ZNF333	Q96JL9	665 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	KATNBL1	Q9H079	304 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.65	□□□□□ -0.7
NXF1-209	ENST00000531474	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	SEPT4	O43236	478 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	STAM2	O75886	525 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	AKR1A1	P14550	325 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	CLCN1	P35523	988 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	SARM1	Q6SZW1	724 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	TNS4	Q8IZW8	715 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	SCFD2	Q8WU76	684 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	SMC2	O95347	1197 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	CYP3A4	P08684	503 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	ITGB5	P18084	799 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	CDC25B	P30305	580 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	TTLL4	Q14679	1199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	IQCB1	Q15051	598 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	LETM2	Q2VYF4	491 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	CEP55	Q53EZ4	464 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	NEK8	Q86SG6	692 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	NLRX1	Q86UT6	975 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	CLIC6	Q96NY7	704 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		10.63	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
NXF1-209	ENST00000531474	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71

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