RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
ACER3-211ENST00000531461 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.71■■■□□ 2.03
ACER3-211ENST00000531461 LMCD1Q9NZU5 365 aa27.71■■■□□ 2.03
ACER3-211ENST00000531461 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
ACER3-211ENST00000531461 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.7■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 LPXNO60711 386 aa27.7■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 GRB10Q13322 594 aa27.69■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.68■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 THPOP40225 353 aa27.68■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa27.68■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 LIFRP42702 1097 aa27.67■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa27.67■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 CYFIP1Q7L576 1253 aa27.67■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 MYL10Q9BUA6 226 aa27.67■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.67■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 BDP1A6H8Y1 2624 aa27.66■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 CALM2P0DP24 149 aa27.66■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 CALM3P0DP25 149 aa27.66■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 GNAT1P11488 350 aa27.66■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 INSL6Q9Y581 213 aa27.65■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 LINC01553A4QN01 128 aa27.64■■■□□ 2.02
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ACER3-211ENST00000531461 ADAM17P78536 824 aa27.64■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 NLRX1Q86UT6 975 aa27.64■■■□□ 2.02
ACER3-211ENST00000531461 PLEKHA8P1O95397 391 aa27.63■■■□□ 2.01
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ACER3-211ENST00000531461 NECTIN1Q15223 517 aa27.63■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.63■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 GPRASP2Q96D09 838 aa27.63■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 CDHR1Q96JP9 859 aa27.63■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 SUGCTQ9HAC7 445 aa27.63■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 BRWD1Q9NSI6 2320 aa27.62■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 SLC27A2O14975 620 aa27.62■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 AMHP03971 560 aa27.62■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 HLA-CQ95604 372 aa27.62■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.62■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 PSTPIP2Q9H939 334 aa27.62■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 KCNQ1P51787 676 aa27.61■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 SEPT8Q92599 483 aa27.61■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 SETD4Q9NVD3 440 aa27.61■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 COL4A6Q14031 1691 aa27.61■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 NRCAMQ92823 1304 aa27.61■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 FAM26DQ5JW98 314 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 CREB3L3Q68CJ9 461 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 RPAINQ86UA6 219 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 TRIM50Q86XT4 487 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 GDPD5Q8WTR4 605 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.6■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 KCNA2P16389 499 aa27.59■■■□□ 2.01
ACER3-211ENST00000531461 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
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