RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528201.1

PACSIN3-204, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-204ENST00000528201 TRAF7Q6Q0C0 670 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SENP7Q9BQF6 1050 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SCN5AQ14524 2016 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 H3BRB1 525 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NOP56O00567 594 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 MYOGP15173 224 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SELPP16109 830 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNA2P16389 499 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 HOXC8P31273 242 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 RCAN1P53805 252 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SP4Q02446 784 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 PTK7Q13308 1070 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 LRRC8DQ7L1W4 858 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 BRF1Q92994 677 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 PGBD1Q96JS3 809 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 RPS6KB1P23443 525 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NAPAP54920 295 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 TCTN1Q2MV58 587 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NLRX1Q86UT6 975 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 GPRASP2Q96D09 838 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 RIC8AQ9NPQ8 531 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SPDYE3A6NKU9 549 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NBNO60934 754 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 REC8O95072 547 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 NEFLP07196 543 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 FOSL2P15408 326 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 FGD1P98174 961 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 RAB30Q15771 203 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 BARHL2Q9NY43 387 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 MSRAQ9UJ68 235 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-204ENST00000528201 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 MBTPS1Q14703 1052 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF618Q5T7W0 954 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PPP1R18Q6NYC8 613 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 FBXL16Q8N461 479 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 USP26Q9BXU7 913 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 MYH7BA7E2Y1 1941 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAMTS3O15072 1205 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 SERINC5Q86VE9 423 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PRDM12Q9H4Q4 367 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 JADE2Q9NQC1 790 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 TMEM260Q9NX78 707 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 NID2Q14112 1375 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 TET1Q8NFU7 2136 aa27.44■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 CXCL10P02778 98 aa27.43■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ACTN1P12814 892 aa27.43■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ADCY7P51828 1080 aa27.43■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 RNPEPQ9H4A4 650 aa27.43■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 C17orf102A2RUQ5 167 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 SMCO2A6NFE2 343 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 TREHO43280 583 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 CLK2P49760 499 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 MTMR1Q13613 665 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ATP6V0A1Q93050 837 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 CDHR1Q96JP9 859 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PPFIA3O75145 1194 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PKN1Q16512 942 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ANO3Q9BYT9 981 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 SETD4Q9NVD3 440 aa27.41■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ARHGEF15O94989 841 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ADGRE1Q14246 886 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 USP38Q8NB14 1042 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 MXRA8Q9BRK3 442 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 OSBPL7Q9BZF2 842 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.4■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 SCG2P13521 617 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PSMA5P28066 241 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 THPOP40225 353 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ADAM17P78536 824 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 NTRK3Q16288 839 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 PHKBQ93100 1093 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 SLC9A7Q96T83 725 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.39■■□□□ 1.98
PACSIN3-204ENST00000528201 VCANP13611 3396 aa27.39■■□□□ 1.97
PACSIN3-204ENST00000528201 DOCK5Q9H7D0 1870 aa27.38■■□□□ 1.97
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