RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 MSH4O15457 936 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 SLC37A4O43826 429 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ZEB2O60315 1214 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 SP2Q02086 613 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 SLC5A5Q92911 643 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.17■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 BRD1O95696 1058 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 MCM7P33993 719 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 DDIT3P35638 169 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 CALCRLQ16602 461 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ANO1Q5XXA6 986 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 POTEDQ86YR6 584 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.16■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 A6NJR5 290 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 KBTBD13C9JR72 458 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 DNM1LO00429 736 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 MARCH6O60337 910 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 KPNA6O60684 536 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 GAS7O60861 476 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ATP9AO75110 1047 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ATP2B1P20020 1258 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 KRT76Q01546 638 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ATL3Q6DD88 541 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 COPS5Q92905 334 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 SPATA33Q96N06 139 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.15■□□□□ 0.98
PTPRK-218ENST00000525459 MOXD2PA6NHM9 499 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PGK1P00558 417 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 LRRC41Q15345 812 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 KLHDC9Q8NEP7 349 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.14■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PSMD10O75832 226 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 MMP3P08254 477 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 OR52Z1P0C646 297 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PKP1Q13835 747 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF174Q15697 407 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 DGKDQ16760 1214 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 GNASQ5JWF2 1037 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 RDM1Q8NG50 284 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 ELP1O95163 1332 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 TCHHQ07283 1943 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa21.13■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 WNT7AO00755 349 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PPFIA4O75335 1185 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 SFNP31947 248 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PRPHP41219 470 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 MTMR9Q96QG7 549 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 CTAGE5O15320 804 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 CABYRO75952 493 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 JAK3P52333 1124 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PPP2R5CQ13362 524 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 AFG1LQ8WV93 481 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 HAS1Q92839 578 aa21.12■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PTGDRQ13258 359 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM266Q2M3C6 531 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 GPR20Q99678 358 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 RAB34Q9BZG1 259 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PCDHA12Q9UN75 941 aa21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 EMSYQ7Z589 1322 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 WDR64B1ANS9 1081 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 NBR1Q14596 966 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 PHF24Q9UPV7 400 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 KAT6AQ92794 2004 aa21.1■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 MYADML2A6NDP7 307 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 ACTR2P61160 394 aa21.09■□□□□ 0.97
PTPRK-218ENST00000525459 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms