RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.66□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.66□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 MTFR1LQ9H019 292 aa5.66□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 EBF1Q9UH73 591 aa5.66□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 GJB6O95452 261 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 POLD1P28340 1107 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 PDE6BP35913 854 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 TEKQ02763 1124 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 CKAP2LQ8IYA6 745 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 C20orf173Q96LM9 149 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A18Q96N87 628 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 TESK2Q96S53 571 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 ASPNQ9BXN1 380 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 GPR160Q9UJ42 338 aa5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.65□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 CASZ1Q86V15 1759 aa5.65□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 RGPD5Q99666 1765 aa5.65□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SHISA3A0PJX4 238 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SHOXO15266 292 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 PSPNO60542 156 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 RAG1P15918 1043 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SLC15A2Q16348 729 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 TNNI3KQ59H18 835 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SHISA4Q96DD7 197 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NBPF4Q96M43 638 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 GCM1Q9NP62 436 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SNTG2Q9NY99 539 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.64□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 PAPPAQ13219 1627 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 LY75O60449 1722 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 BTAF1O14981 1849 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 HOXC9P31274 260 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 TXNRD1Q16881 649 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 FAM178BQ8IXR5 827 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 LILRB2Q8N423 598 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 LGR4Q9BXB1 951 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 PARD6AQ9NPB6 346 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 MAP3K19Q56UN5 1328 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NCAPD2Q15021 1401 aa5.63□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 COL24A1Q17RW2 1714 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 PKD1L3Q7Z443 1732 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 CBFA2T2O43439 604 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 BMP7P18075 431 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF385BQ569K4 471 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 TCERG1LQ5VWI1 586 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SPATC1Q76KD6 591 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NME9Q86XW9 330 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NLGN1Q8N2Q7 840 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 MKL1Q969V6 931 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 RELTQ969Z4 430 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SGPP1Q9BX95 441 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 KCTD3Q9Y597 815 aa5.62□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 OR14I1A6ND48 311 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NOTOA8MTQ0 251 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 TP53P04637 393 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 GALK1P51570 392 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 MYOM1P52179 1685 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 CHD4Q14839 1912 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 DCAF15Q66K64 600 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.61□□□□□ -1.51
HDAC2-216ENST00000523628 NLRX1Q86UT6 975 aa5.61□□□□□ -1.51
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