RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA33Q96N06 139 aa23.44■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.44■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.44■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLDND1Q9NY35 253 aa23.44■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NEDD4P46934 1319 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 H3BRB1 525 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TREHO43280 583 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MBTPS2O43462 519 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GGPS1O95749 300 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RPAINQ86UA6 219 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SNX27Q96L92 541 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFBP00751 764 aa23.42■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HYAL1Q12794 435 aa23.42■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PGM5Q15124 567 aa23.42■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 APBB2Q92870 758 aa23.42■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BMPR1AP36894 532 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDE1AP54750 535 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EDAQ92838 391 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL17RAQ96F46 866 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYH6P13533 1939 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GRM6O15303 877 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UPP2O95045 317 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNF135Q8IUD6 432 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL31RAQ8NI17 732 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AMNQ9BXJ7 453 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LGALS2P05162 132 aa23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CAMK1Q14012 370 aa23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IQCA1Q86XH1 822 aa23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FIBCD1Q8N539 461 aa23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP26Q9BXU7 913 aa23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KAT14Q9H8E8 782 aa23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.39■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CFAP54Q96N23 3096 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KDM4AO75164 1064 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TBX10O75333 385 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EYA4O95677 639 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADAM15Q13444 863 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MSLNLQ96KJ4 702 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PHOX2BQ99453 314 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RWDD3Q9Y3V2 267 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF213O14771 459 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ICAM3P32942 547 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PRSS33Q8NF86 280 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CTNNB1P35222 781 aa23.36■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.36■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.36■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SETD4Q9NVD3 440 aa23.36■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SORBS3O60504 671 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CHRNA1P02708 482 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MMP1P03956 469 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CTSHP09668 335 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GNAT1P11488 350 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLVAPQ9BX97 442 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LAMA4Q16363 1823 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZBTB5O15062 677 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PKN1Q16512 942 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IER5LQ5T953 404 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 METTL7BQ6UX53 244 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 P2RX5Q93086 422 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GPR20Q99678 358 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CD207Q9UJ71 328 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TTC3P53804 2025 aa23.33■■□□□ 1.33
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms