RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EDIL3O43854 480 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMD10O75832 226 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIF20AO95235 890 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GJA5P36382 358 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SARSP49591 514 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 JAK3P52333 1124 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASIC1P78348 528 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MOGSQ13724 837 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM119Q4V9L6 283 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CST9Q5W186 159 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OTOP1Q7RTM1 612 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MIER3Q7Z3K6 550 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPATA20Q8TB22 786 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MS4A4AQ96JQ5 239 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NACC1Q96RE7 527 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COL20A1Q9P218 1284 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASB14A6NK59 587 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IKBKBO14920 756 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ARP10275 920 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ITGB5P18084 799 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMD2Q13200 908 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRB10Q13322 594 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MORC3Q14149 939 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP2W1Q8TAV3 490 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.66□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WDR64B1ANS9 1081 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHMP2AO43633 222 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TPM3P06753 285 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 P4HBP07237 508 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLA2G4BP0C869 781 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TGFB3P10600 412 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MAPK4P31152 587 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYL5Q02045 173 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DPCR1Q3MIW9 517 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ISM2Q6H9L7 571 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TPH2Q8IWU9 490 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABRAQ8N0Z2 381 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BRI3BPQ8WY22 251 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HHIPL1Q96JK4 782 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BLZF1Q9H2G9 400 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KCND2Q9NZV8 630 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VAV3Q9UKW4 847 aa13.65□□□□□ -0.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NFASCO94856 1347 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSMA7O14818 248 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FOXN1O15353 648 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRR29P0C7W0 189 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP2C8P10632 490 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CUL4BQ13620 913 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NEDD9Q14511 834 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MCM6Q14566 821 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NAALADL2Q58DX5 795 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SAPCD2Q86UD0 394 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LUZP1Q86V48 1076 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CATSPER3Q86XQ3 398 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 AOPEPQ8N6M6 819 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 STAMQ92783 540 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PNMA5Q96PV4 448 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRIM9Q9C026 710 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa13.64□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 POTEB3A0JP26 581 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BICDL2A1A5D9 508 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CBFA2T2O43439 604 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CNMDO75829 334 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TOMM70O94826 608 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RHOBTB3O94955 611 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EYA4O95677 639 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PSAPP07602 524 aa13.63□□□□□ -0.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IDEP14735 1019 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms