RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.62
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ITGA3-211ENST00000508100 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.91■□□□□ 0.62
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ITGA3-211ENST00000508100 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 FRMPD4Q14CM0 1322 aa18.87■□□□□ 0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 YME1L1Q96TA2 773 aa18.87■□□□□ 0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 NLRX1Q86UT6 975 aa18.86■□□□□ 0.61
ITGA3-211ENST00000508100 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
ITGA3-211ENST00000508100 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.86■□□□□ 0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.85■□□□□ 0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 TOP1MTQ969P6 601 aa18.85■□□□□ 0.61
ITGA3-211ENST00000508100 FAM122AQ96E09 287 aa18.85■□□□□ 0.61
ITGA3-211ENST00000508100 MAP3K14Q99558 947 aa18.85■□□□□ 0.61
ITGA3-211ENST00000508100 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.85■□□□□ 0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 SPZ1Q9BXG8 430 aa18.85■□□□□ 0.61
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ITGA3-211ENST00000508100 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
ITGA3-211ENST00000508100 TMTC2Q8N394 836 aa18.83■□□□□ 0.6
ITGA3-211ENST00000508100 MAP4K1Q92918 833 aa18.83■□□□□ 0.6
ITGA3-211ENST00000508100 CDHR1Q96JP9 859 aa18.83■□□□□ 0.6
ITGA3-211ENST00000508100 KAT6AQ92794 2004 aa18.83■□□□□ 0.6
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC69A6NI79 296 aa18.82■□□□□ 0.6
ITGA3-211ENST00000508100 MEIS2O14770 477 aa18.82■□□□□ 0.6
ITGA3-211ENST00000508100 PLA2G5P39877 138 aa18.82■□□□□ 0.6
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