RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 SPDYE3A6NKU9 549 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 STXBP3O00186 592 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 NOP56O00567 594 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 PPFIA3O75145 1194 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 REC8O95072 547 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 RPS6KB1P23443 525 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 NEDD9Q14511 834 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 XRRA1Q6P2D8 792 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF576Q9H609 170 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 TMEM260Q9NX78 707 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 UNC80Q8N2C7 3258 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 H3BRB1 525 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 ADAMTS3O15072 1205 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 PFKMP08237 780 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 MYOGP15173 224 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 SELPP16109 830 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 KCNA2P16389 499 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 RFC2P35250 354 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 TCTN1Q2MV58 587 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 TRAF7Q6Q0C0 670 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC8DQ7L1W4 858 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 NLRX1Q86UT6 975 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 CAGE1Q8TC20 777 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 AFAP1L1Q8TED9 768 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.97■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 CKBP12277 381 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 RCAN1P53805 252 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 RBL2Q08999 1139 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 PPP1R18Q6NYC8 613 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC155Q8N6L0 562 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 GPRASP2Q96D09 838 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 BARHL2Q9NY43 387 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa17.96■□□□□ 0.47
SH3BP2-211ENST00000506932 A0A0C4DFX4 3053 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 NID2Q14112 1375 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 NBNO60934 754 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 FOSL2P15408 326 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ADCY7P51828 1080 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 PTK7Q13308 1070 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 MTMR1Q13613 665 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 MBTPS1Q14703 1052 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF618Q5T7W0 954 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ANO3Q9BYT9 981 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.95■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 SMCO2A6NFE2 343 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 TREHO43280 583 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 HOXC8P31273 242 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 RAB30Q15771 203 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 SERINC5Q86VE9 423 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 PHKBQ93100 1093 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 USP26Q9BXU7 913 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 PRDM12Q9H4Q4 367 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 JADE2Q9NQC1 790 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 SETD4Q9NVD3 440 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 MSRAQ9UJ68 235 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 hCG_1984214I3L0E3 225 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ACTN1P12814 892 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 SCG2P13521 617 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 CLK2P49760 499 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 PKN1Q16512 942 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 FBXL16Q8N461 479 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP6V0A1Q93050 837 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 ARP10275 920 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 PSMA5P28066 241 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 THPOP40225 353 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 CCT2P78371 535 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 NTRK3Q16288 839 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 CDHR1Q96JP9 859 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 OSBPL7Q9BZF2 842 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP2-211ENST00000506932 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms