RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 RTP1P59025 263 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 PSMC6P62333 389 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 GUCY1B3Q02153 619 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 NR5A1Q13285 461 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 LAMC2Q13753 1193 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 NEDD9Q14511 834 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 SNX17Q15036 470 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 CEP55Q53EZ4 464 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MYSM1Q5VVJ2 828 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 KRT40Q6A162 431 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MCTP2Q6DN12 878 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 TBCKQ8TEA7 893 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.86□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 GRIN2DO15399 1336 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 ELP1O95163 1332 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 FAM205CA6NFA0 338 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 BTBD18B2RXH4 712 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MEIS1O00470 390 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MMP1P03956 469 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 CIITAP33076 1130 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 KRT2P35908 639 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 SP4Q02446 784 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 INF2Q27J81 1249 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 TRIM60Q495X7 471 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 METTL7BQ6UX53 244 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 C7orf61Q8IZ16 206 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 PPTC7Q8NI37 304 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 TNFRSF25Q93038 417 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 CDHR1Q96JP9 859 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 C8orf76Q96K31 380 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 SPATA33Q96N06 139 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 UIMC1Q96RL1 719 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa9.85□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MAFGO15525 162 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 EVI5O60447 810 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 TDP2O95551 362 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 ZNF286BP0CG31 522 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 CDK7P50613 346 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 CUL4AQ13619 759 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 TRIM29Q14134 588 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 PRR16Q569H4 304 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 KAT2BQ92831 832 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 LENG9Q96B70 501 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 GPR20Q99678 358 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 POLR3EQ9NVU0 708 aa9.84□□□□□ -0.83
PKP4-216ENST00000495123 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 ARVCFO00192 962 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 KPNA6O60684 536 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 CABYRO75952 493 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 SYN1P17600 705 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 GJB2P29033 226 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 USP11P51784 963 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 ITGA7Q13683 1181 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 DGKDQ16760 1214 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 NFASCO94856 1347 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 KIF28PB7ZC32 967 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 WNT7AO00755 349 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 MSH4O15457 936 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 SLC37A4O43826 429 aa9.82□□□□□ -0.84
PKP4-216ENST00000495123 PPFIA4O75335 1185 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms