RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GJA5	P36382	358 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PPAT	Q06203	517 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SPP2	Q13103	211 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NOG	Q13253	232 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NR1I3	Q14994	352 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP135	Q66GS9	1140 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TC2N	Q8N9U0	490 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	WNK4	Q96J92	1243 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	EHD4	Q9H223	541 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		6.55	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GTH6	734 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	USP17L10	C9JJH3	530 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	DYNC1I1	O14576	645 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC37A4	O43826	429 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NEMF	O60524	1076 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPA1	O75762	1119 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINC1	P01008	464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ASNS	P08243	561 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SMARCA1	P28370	1054 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC16A2	P36021	539 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TM4SF4	P48230	202 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NT5C2	P49902	561 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NAPA	P54920	295 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GSDMD	P57764	484 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	INHBE	P58166	350 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF543	Q08ER8	600 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SEPT2	Q15019	361 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	UBE2S	Q16763	222 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA1	Q5VX52	437 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	KANK3	Q6NY19	840 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730		Q8N3U1	123 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC13	Q8NBP0	860 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GJA10	Q969M2	543 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR8	Q96EF0	704 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GSDMA	Q96QA5	445 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR9	Q96QG7	549 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPN18	Q99952	460 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SWAP70	Q9UH65	585 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		6.54	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ESYT2	A0FGR8	921 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CXCL11	O14625	94 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TDP2	O95551	362 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	TBC1D8	O95759	1140 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CETP	P11597	493 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PRCP	P42785	496 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GTF2A2	P52657	109 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SNAP25	P60880	206 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	ATP2B2	Q01814	1243 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	GRB10	Q13322	594 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	PPIL2	Q13356	520 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	SNAPC2	Q13487	334 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	DGKZ	Q13574	1117 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	MTF1	Q14872	753 aa		6.53	□□□□□ -1.36
C4BPB-208	ENST00000492730	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36

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