RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492275.5

TTC3-223, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 3

Gene TTC3, Length 769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-223	ENST00000492275	KAT2B	Q92831	832 aa		29.39	■■■□□ 2.3
TTC3-223	ENST00000492275	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		29.39	■■■□□ 2.3
TTC3-223	ENST00000492275	PPFIA4	O75335	1185 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	USP11	P51784	963 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	29.37	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	KRT40	Q6A162	431 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	TOX2	Q96NM4	488 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	GPR20	Q99678	358 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	SYN1	P17600	705 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	MMP1	P03956	469 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF286B	P0CG31	522 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	FAAP100	Q0VG06	881 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	29.35	■■■□□ 2.29	5e-9	■■■■□ 22.3
TTC3-223	ENST00000492275	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	TNFRSF25	Q93038	417 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	LENG9	Q96B70	501 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	KRT2	P35908	639 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	SP4	Q02446	784 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	NR5A1	Q13285	461 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM29	Q14134	588 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	PRR16	Q569H4	304 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	NFASC	O94856	1347 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		29.34	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	CEP290	O15078	2479 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	GUCY1B3	Q02153	619 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	INF2	Q27J81	1249 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	C8orf76	Q96K31	380 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	UIMC1	Q96RL1	719 aa		29.33	■■■□□ 2.29
TTC3-223	ENST00000492275	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	BTBD18	B2RXH4	712 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	HAS3	O00219	553 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	F2	P00734	622 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	CD4	P01730	458 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	CLTB	P09497	229 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	CYP3A7	P24462	503 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	PSEN2	P49810	448 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	FAM205C	A6NFA0	338 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	LGALS2	P05162	132 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	SDF4	Q9BRK5	362 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		29.31	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TDP2	O95551	362 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	CHMP4BP1	P59074	171 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	MFSD10	Q14728	455 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	MBOAT7	Q96N66	472 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	LTBP2	Q14767	1821 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	B4GALT4	O60513	344 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275		Q4G0T1	1027 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		29.29	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	KIAA0355	O15063	1070 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	MSH4	O15457	936 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	LETM2	Q2VYF4	491 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	NEK8	Q86SG6	692 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TRIM50	Q86XT4	487 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	TBX21	Q9UL17	535 aa		29.28	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275		H3BRB1	525 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TTC3-223	ENST00000492275	CCNE2	O96020	404 aa		29.27	■■■□□ 2.28

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