RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF202	O95125	648 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	FCER1A	P12319	257 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	PRPH	P41219	470 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	SYK	P43405	635 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	FPGS	Q05932	587 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	UBE2S	Q16763	222 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	SDF4	Q9BRK5	362 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.92	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	PFKFB1	P16118	471 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	COL9A1	P20849	921 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	DNAJB2	P25686	324 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	DSG3	P32926	999 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	NDUFA8	P51970	172 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	OAZ1	P54368	228 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	ANO3	Q9BYT9	981 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	HPSE	Q9Y251	543 aa		13.91	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	MUC3A	Q02505	3323 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	WNT7A	O00755	349 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	NEMF	O60524	1076 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	CFB	P00751	764 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	OR52Z1	P0C646	297 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	ITGB8	P26012	769 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	GRIN2C	Q14957	1233 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	CAMK4	Q16566	473 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	MAF1	Q9H063	256 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF576	Q9H609	170 aa		13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF536	O15090	1300 aa		13.9	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1W2PQY0	241 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	VWA5A	O00534	786 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MARCH6	O60337	910 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC25A27	O95847	323 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	PGK1	P00558	417 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TXLNA	P40222	546 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	EPHB4	P54760	987 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	AK8	Q96MA6	479 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MMP19	Q99542	508 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.89	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ALAS1	P13196	640 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CYP3A7	P24462	503 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CALCRL	Q16602	461 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	SPECC1	Q5M775	1068 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	USP38	Q8NB14	1042 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ATG4C	Q96DT6	458 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	TSPY26P	Q9H489	355 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	OPLAH	O14841	1288 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	CYP3A4	P08684	503 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	AKR1A1	P14550	325 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF76	P36508	570 aa		13.87	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms