RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 STAM2O75886 525 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 CNTN2Q02246 1040 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 MCM6Q14566 821 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.43e-6■■■■■ 37.6
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HOXB3-210ENST00000489475 NLRX1Q86UT6 975 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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HOXB3-210ENST00000489475 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa30.02■■■□□ 2.4
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HOXB3-210ENST00000489475 C7orf25Q9BPX7 421 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 TRIM9Q9C026 710 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D22BQ9NU19 505 aa30.02■■■□□ 2.4
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HOXB3-210ENST00000489475 UNC45AQ9H3U1 944 aa30.01■■■□□ 2.4
HOXB3-210ENST00000489475 MAFGO15525 162 aa30.01■■■□□ 2.39
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa30.01■■■□□ 2.39
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HOXB3-210ENST00000489475 WDR78Q5VTH9 848 aa30■■■□□ 2.39
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HOXB3-210ENST00000489475 KCTD17Q8N5Z5 321 aa29.99■■■□□ 2.39
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HOXB3-210ENST00000489475 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
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HOXB3-210ENST00000489475 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.97■■■□□ 2.39
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HOXB3-210ENST00000489475 B4DLN1 442 aa29.96■■■□□ 2.39
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HOXB3-210ENST00000489475 TPH2Q8IWU9 490 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-210ENST00000489475 NEK9Q8TD19 979 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-210ENST00000489475 EXOC1Q9NV70 894 aa29.95■■■□□ 2.39
HOXB3-210ENST00000489475 RHOBTB3O94955 611 aa29.94■■■□□ 2.38
HOXB3-210ENST00000489475 PDE4DQ08499 809 aa29.94■■■□□ 2.38
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