RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 KRT15P19012 456 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 AMY2BP19961 511 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 JAM2P57087 298 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 STRN3Q13033 797 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 USP7Q93009 1102 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 RNF114Q9Y508 228 aa6.92□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SLC12A8A0AV02 714 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 BRINP1O60477 761 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 TADA3O75528 432 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 DSG1Q02413 1049 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ADGRF1Q5T601 910 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ATL2Q8NHH9 583 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 TTC1Q99614 292 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 BOCQ9BWV1 1114 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NUDT19A8MXV4 375 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 F8W031 263 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZEB2O60315 1214 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB7AO95365 584 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 EYA4O95677 639 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 BPIP17213 487 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 FIGNQ5HY92 759 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 NXPE1Q8N323 547 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SMC1BQ8NDV3 1235 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 SH3RF2Q8TEC5 729 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-204ENST00000489160 MYOTQ9UBF9 498 aa6.9□□□□□ -1.3
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CCL20-204ENST00000489160 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.9□□□□□ -1.3
CCL20-204ENST00000489160 OR14I1A6ND48 311 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 MAN2B1O00754 1011 aa6.89□□□□□ -1.31
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CCL20-204ENST00000489160 IL2P60568 153 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 OCRLQ01968 901 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 SLC9A5Q14940 896 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 RPTNQ6XPR3 784 aa6.89□□□□□ -1.31
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CCL20-204ENST00000489160 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 PALD1Q9ULE6 856 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.89□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 SLC27A2O14975 620 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 TXKP42681 527 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 LSSP48449 732 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 EPHA5P54756 1037 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 IRF9Q00978 393 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 CD244Q9BZW8 370 aa6.88□□□□□ -1.31
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CCL20-204ENST00000489160 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 ALG1L2C9J202 215 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 H7C1D1 291 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 HRKO00198 91 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 NEMP1O14524 444 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 KCNK3O14649 394 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 HIP1RO75146 1068 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 FKBP9O95302 570 aa6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CCL20-204ENST00000489160 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.315e-11■■□□□ 11.4
CCL20-204ENST00000489160 PMLP29590 882 aa6.87□□□□□ -1.31
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