RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 GRIN1Q05586 938 aa5.1□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.1□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 OR6P1Q8NGX9 317 aa5.1□□□□□ -1.59
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SENP6-210ENST00000487548 NAT2P11245 290 aa5.09□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 GTF2A2P52657 109 aa5.09□□□□□ -1.59
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SENP6-210ENST00000487548 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SENP6-210ENST00000487548 COL6A1P12109 1028 aa5.08□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 PTPN22Q9Y2R2 807 aa5.08□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 FUKQ8N0W3 1084 aa5.05□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa5.05□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 DLL4Q9NR61 685 aa5.05□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.05□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 MCM7P33993 719 aa5.04□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 NCAPHQ15003 741 aa5.04□□□□□ -1.6
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SENP6-210ENST00000487548 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa5.04□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.04□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 B2RBV5 119 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 KRIT1O00522 736 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 MAFKO60675 156 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 LTFP02788 710 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 C1SP09871 688 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 DENND5AQ6IQ26 1287 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.03□□□□□ -1.6
SENP6-210ENST00000487548 TMEM145Q8NBT3 493 aa5.03□□□□□ -1.6
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