RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 SEZ6Q53EL9 994 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 PRR5LQ6MZQ0 368 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 CDH24Q86UP0 819 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 ZNF654Q8IZM8 581 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 RIN3Q8TB24 985 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 NKD1Q969G9 470 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 KLHL3Q9UH77 587 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.09□□□□□ -1.43
CNN3-206ENST00000487539 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PP64 1363 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ADAMTS20P59510 1910 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SASH1O94885 1247 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 TBC1D8O95759 1140 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 MCM4P33991 863 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 TNNI2P48788 182 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 HUNKP57058 714 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CHMP4BP1P59074 171 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ZNF394Q53GI3 561 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 TBC1D9BQ66K14 1250 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 GPC2Q8N158 579 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 DNAJB8Q8NHS0 232 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 GMIPQ9P107 970 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 NARFQ9UHQ1 456 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 TJP1Q07157 1748 aa6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ZNF831Q5JPB2 1677 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SHTN1A0MZ66 631 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 UNCXA6NJT0 531 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SRGNP10124 158 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 COG3Q96JB2 828 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SPATA32Q96LK8 384 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.07□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CBX7O95931 251 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 IMPDH2P12268 514 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 RAC2P15153 192 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 RAG1P15918 1043 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 GBP1P32455 592 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PDE6BP35913 854 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ZNF385BQ569K4 471 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 STYK1Q6J9G0 422 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 RGMBQ6NW40 437 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 GK5Q6ZS86 529 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 RNF141Q8WVD5 230 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.06□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PRR33A8MZF0 331 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CLCQ05315 142 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SPATS1Q496A3 300 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CCDC93Q567U6 631 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 TTC6Q86TZ1 520 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 CCDC120Q96HB5 630 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 ASPNQ9BXN1 380 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 KCTD3Q9Y597 815 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.05□□□□□ -1.44
CNN3-206ENST00000487539 RTL1A6NKG5 1358 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms