RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 PCNX4Q63HM2 1172 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF207Q6ZRF8 634 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 UNC13DQ70J99 1090 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNK18Q7Z418 384 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ERO1BQ86YB8 467 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ADSSL1Q8N142 457 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 NELFBQ8WX92 580 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ABHD8Q96I13 439 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 WNK4Q96J92 1243 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MXRA8Q9BRK3 442 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TEX13BQ9BXU2 312 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MAF1Q9H063 256 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 HOXC10Q9NYD6 342 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SMCHD1A6NHR9 2005 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RLFQ13129 1914 aa11.6□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEB3A0JP26 581 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMA7O14818 248 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 GAS7O60861 476 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MED24O75448 989 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 BCRP11274 1271 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PTGS1P23219 599 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RPA1P27694 616 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PRCPP42785 496 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 STX17P56962 302 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 UBASH3AP57075 661 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 RPS6P62753 249 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP2R5CQ13362 524 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEBQ6S5H4 581 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 NSMFQ6X4W1 530 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC186Q7Z3E2 898 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 WDR11Q9BZH6 1224 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ELP3Q9H9T3 547 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 IMPACTQ9P2X3 320 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 LOC285556D6RIA3 1793 aa11.59□□□□□ -0.55
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEFA5A3E0 1075 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCL11O14625 94 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMD10O75832 226 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PLA2G4BP0C869 781 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SREBF2Q12772 1141 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 XRRA1Q6P2D8 792 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEGQ6S5H5 508 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 GPBP1Q86WP2 473 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CATSPER3Q86XQ3 398 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 IL31RAQ8NI17 732 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX12PQ92771 950 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TAAR1Q96RJ0 339 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 RIT2Q99578 217 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TEKT3Q9BXF9 490 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 NRBP1Q9UHY1 535 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 RIPK3Q9Y572 518 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa11.58□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 E9PMD0 336 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ARP10275 920 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGB5P18084 799 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 GSDMDP57764 484 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 SPAG1Q07617 926 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMD2Q13200 908 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PPIL2Q13356 520 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 PGM5Q15124 567 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 TREML2Q5T2D2 321 aa11.57□□□□□ -0.56
GTPBP1-211ENST00000487538 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.57□□□□□ -0.56
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