RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 ITGB5P18084 799 aa30.6■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 NEK4P51957 841 aa30.6■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CCL23P55773 120 aa30.6■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PKN1Q16512 942 aa30.6■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 H3BRB1 525 aa30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CSF2RAP15509 400 aa30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 CEP55Q53EZ4 464 aa30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SESTD1Q86VW0 696 aa30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 KAT2BQ92831 832 aa30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS54Q9P1Q0 977 aa30.59■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SREBF1P36956 1147 aa30.58■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGAP4P98171 946 aa30.58■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 SEMA3FQ13275 785 aa30.58■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR20Q99678 358 aa30.58■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 HDAC6Q9UBN7 1215 aa30.58■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa30.58■■■□□ 2.49
CCZ1B-211ENST00000486840 LGALS2P05162 132 aa30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 CLK2P49760 499 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 AK2P54819 239 aa30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 C9orf50Q5SZB4 431 aa30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SEPT1Q8WYJ6 367 aa30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 C22orf23Q9BZE7 217 aa30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 IL23AQ9NPF7 189 aa30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa30.57■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 GNAT1P11488 350 aa30.56■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 WASF1Q92558 559 aa30.56■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 KCNH7Q9NS40 1196 aa30.56■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 PFKFB2O60825 505 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC34A2O95436 690 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SEC24BO95487 1268 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 FGBP02675 491 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 CAGE1Q8TC20 777 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 GLG1Q92896 1179 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 LRCH3Q96II8 777 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 TPCN1Q9ULQ1 816 aa30.55■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 HAS3O00219 553 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 PITPNM1O00562 1244 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP9AO75110 1047 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 ACRP10323 421 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 KCNA2P16389 499 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SCRN1Q12765 414 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 AZI2Q9H6S1 392 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 BCAS3Q9H6U6 928 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 LTBP2Q14767 1821 aa30.54■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 MYH7BA7E2Y1 1941 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 C17orf102A2RUQ5 167 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 EPHB4P54760 987 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 GALNT17Q6IS24 598 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR153Q6NV75 609 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 NIPA1Q7RTP0 329 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 PLA2G4DQ86XP0 818 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 C16orf70Q9BSU1 422 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC9A2Q9UBY0 812 aa30.53■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 UMODL1Q5DID0 1318 aa30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 PFKMP08237 780 aa30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 ACTN1P12814 892 aa30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 RFC2P35250 354 aa30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF365Q70YC5 407 aa30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 SCLYQ96I15 445 aa30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.52■■■□□ 2.48
CCZ1B-211ENST00000486840 MEIS1O00470 390 aa30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP3A4P08684 503 aa30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 SETQ01105 290 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 AFAP1L1Q8TED9 768 aa30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP6V0A1Q93050 837 aa30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHA4Q9UN74 947 aa30.51■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 PTK7Q13308 1070 aa30.5■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM240Q5SV17 173 aa30.5■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP2W1Q8TAV3 490 aa30.5■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 IL17RAQ96F46 866 aa30.5■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 ERAP1Q9NZ08 941 aa30.5■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 NFASCO94856 1347 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 PARNO95453 639 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 ARP10275 920 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 DEFB128Q7Z7B8 93 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 BLIDQ8IZY5 108 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 RASGRP4Q8TDF6 673 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 WNT8AQ9H1J5 351 aa30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
CCZ1B-211ENST00000486840 IQCF3P0C7M6 154 aa30.48■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms