RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470980.1

GREB1-208, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, human

TSL 3

Gene GREB1, Length 833 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GREB1-208	ENST00000470980	CEP290	O15078	2479 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	BECN2	A8MW95	431 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MSH4	O15457	936 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CAPN2	P17655	700 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CASP1	P29466	404 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	HERVK_113	P62684	666 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	DPYD	Q12882	1025 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	LBX2	Q6XYB7	198 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	ERMN	Q8TAM6	284 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	RMDN3	Q96TC7	470 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CPA4	Q9UI42	421 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	RLF	Q13129	1914 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		10.44	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MEIS1	O00470	390 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SLC26A4	O43511	780 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	HOXD10	P28358	340 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PSMC4	P43686	418 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PLCB2	Q00722	1185 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	GRB10	Q13322	594 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CUL4B	Q13620	913 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CHST13	Q8NET6	341 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	IL31RA	Q8NI17	732 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	RMND1	Q9NWS8	449 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	BTBD7	Q9P203	1132 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	STK17A	Q9UEE5	414 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PTPRF	P10586	1907 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PEX10	O60683	326 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	GAS7	O60861	476 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	AR	P10275	920 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CCND2	P30279	289 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	GRK4	P32298	578 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	GJA8	P48165	433 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	FXR1	P51114	621 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	AMPD3	Q01432	767 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MORC3	Q14149	939 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	IQCB1	Q15051	598 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PGM5	Q15124	567 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SV2B	Q7L1I2	683 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SPATA20	Q8TB22	786 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	LRRC15	Q8TF66	581 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	GSDMA	Q96QA5	445 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MTR	Q99707	1265 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	MAF1	Q9H063	256 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	FBXO40	Q9UH90	709 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	VAV3	Q9UKW4	847 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GREB1-208	ENST00000470980	SMTNL1	A8MU46	457 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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