RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 ME3Q16798 604 aa22.71■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 CEP55Q53EZ4 464 aa22.71■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.71■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 GPR20Q99678 358 aa22.71■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.71■■□□□ 1.23
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF76P36508 570 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 FPGSQ05932 587 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD10Q14728 455 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 MFSD5Q6N075 450 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 SESTD1Q86VW0 696 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 NECAB1Q8N987 351 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 GTF3C6Q969F1 213 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 AIFM3Q96NN9 605 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 ALG1Q9BT22 464 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 HIPK3Q9H422 1215 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 STK36Q9NRP7 1315 aa22.7■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 HAS3O00219 553 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 LARGE1O95461 756 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 LGALS2P05162 132 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 SP4Q02446 784 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 C7orf31Q8N865 590 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 KIF2CQ99661 725 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.69■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 MEIS1O00470 390 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 CTDNEP1O95476 244 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 CYP3A4P08684 503 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2C9P11712 490 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2C18P33260 490 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM199Q8N511 208 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 NOD1Q9Y239 953 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.68■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 H3BRB1 525 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 ARP10275 920 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 PTGISQ16647 500 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 GALNT17Q6IS24 598 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.67■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 FAM86B1E9PN63 330 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 DTNBO60941 627 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 XBP1P17861 261 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 EPHB4P54760 987 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 SHHQ15465 462 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 BLIDQ8IZY5 108 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 SDF4Q9BRK5 362 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 SZT2Q5T011 3432 aa22.66■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 NFASCO94856 1347 aa22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 CSF2RAP15509 400 aa22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 WASF1Q92558 559 aa22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTPS1-206ENST00000470271 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.64■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 CCL23P55773 120 aa22.64■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 NPY5RQ15761 445 aa22.64■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM50Q86XT4 487 aa22.64■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.64■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.64■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.64■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 M0R2N6 131 aa22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 CIITAP33076 1130 aa22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 BFSP2Q13515 415 aa22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.63■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 PITPNM1O00562 1244 aa22.62■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 USP11P51784 963 aa22.62■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 PRR16Q569H4 304 aa22.62■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CTPS1-206ENST00000470271 JAK2O60674 1132 aa22.61■■□□□ 1.21
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