RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		33.48	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		33.48	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNA2	P16389	499 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	SREBF1	P36956	1147 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	SCRN1	Q12765	414 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	GPR20	Q99678	358 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		33.47	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	HAS3	O00219	553 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	33.46	■■■□□ 2.95	2e-9	■■■■□ 21.8
FBXO18-208	ENST00000470089	C7orf31	Q8N865	590 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	NOD1	Q9Y239	953 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	SZT2	Q5T011	3432 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	DTNB	O60941	627 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	LGALS2	P05162	132 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	GNA11	P29992	359 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	PTGIS	Q16647	500 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	SESTD1	Q86VW0	696 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FBXO18-208	ENST00000470089	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	33.45	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	ACR	P10323	421 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	NEK4	P51957	841 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	ARHGAP4	P98171	946 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKRD1	Q15327	319 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	PFKFB2	O60825	505 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	DEXI	O95424	95 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	SCLY	Q96I15	445 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	AIFM3	Q96NN9	605 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	33.43	■■■□□ 2.94	5e-10	■□□□□ 11.1
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		33.43	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	SCN5A	Q14524	2016 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	AR	P10275	920 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF76	P36508	570 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	NLRP5	P59047	1200 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	CEP55	Q53EZ4	464 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	TRIM50	Q86XT4	487 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089		H3BRB1	525 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	MAFG	O15525	162 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	BICD2	Q8TD16	824 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	LARGE1	O95461	756 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	NECAB1	Q8N987	351 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	IL23A	Q9NPF7	189 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	CDKL5	O76039	1030 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	HIC1	Q14526	733 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	TMEM240	Q5SV17	173 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	MCTP2	Q6DN12	878 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM86B1	E9PN63	330 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	MEIS1	O00470	390 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	ME3	Q16798	604 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF365	Q70YC5	407 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	UIMC1	Q96RL1	719 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	33.37	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	CTDNEP1	O95476	244 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	CYP3A4	P08684	503 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	BFSP2	Q13515	415 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	RETREG2	Q8NC44	543 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	SDF4	Q9BRK5	362 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF215	Q9UL58	517 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		33.35	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	STK36	Q9NRP7	1315 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	PITPNM1	O00562	1244 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	NFASC	O94856	1347 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FBXO18-208	ENST00000470089	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		33.33	■■■□□ 2.93

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