RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 PMLP29590 882 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 DSG1Q02413 1049 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 STRN3Q13033 797 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNMB1Q16558 191 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 FYB2Q5VWT5 728 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ATL2Q8NHH9 583 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 IFT22Q9H7X7 185 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ALG1L2C9J202 215 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 F8W031 263 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 HRKO00198 91 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 HIP1RO75146 1068 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 AMY2AP04746 511 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 BPIP17213 487 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT15P19012 456 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 AMY2BP19961 511 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 GJA4P35212 333 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE6BP35913 854 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 MAPKAPK2P49137 400 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 JAM2P57087 298 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB3GAP1Q15042 981 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRF1Q5T601 910 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TSPAN17Q96FV3 270 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 MYOTQ9UBF9 498 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 H7C1D1 291 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 EYA4O95677 639 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 EPHA5P54756 1037 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 KCTD1Q719H9 257 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 MILR1Q7Z6M3 343 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 C11orf74Q86VG3 221 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 SMC1BQ8NDV3 1235 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ASH2LQ9UBL3 628 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PALD1Q9ULE6 856 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT19A8MXV4 375 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-205ENST00000462042 ITGB5P18084 799 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 LSSP48449 732 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 GALK1P51570 392 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 IL2P60568 153 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF174Q15697 407 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 RPTNQ6XPR3 784 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 PASD1Q8IV76 773 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-205ENST00000462042 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGGTB-205ENST00000462042 FKBP9O95302 570 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 IRF9Q00978 393 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FKBP9P1Q75LS8 142 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NECAB2Q7Z6G3 386 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NXPE1Q8N323 547 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 EFHBQ8N7U6 833 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TTLL11Q8NHH1 800 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGGTB-205ENST00000462042 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 KLHL14Q9P2G3 628 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC27A2O14975 620 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 IRAK1P51617 712 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FAPQ12884 760 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 TUSC3Q13454 348 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 STAT4Q14765 748 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ACSS2Q9NR19 701 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 SIT1Q9Y3P8 196 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NEMP1O14524 444 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR39O43194 453 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ULK1O75385 1050 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PAPLNO95428 1278 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR5P85299 388 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 NOSTRINQ8IVI9 506 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM168AQ92567 244 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-205ENST00000462042 DLG3Q92796 817 aa7.69□□□□□ -1.18
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