RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460330.5

PTGER3-209, Transcript of prostaglandin E receptor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGER3, Length 1,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3-209ENST00000460330 CYP3A7P24462 503 aa21.87■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 UIMC1Q96RL1 719 aa21.87■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.87■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 LETM2Q2VYF4 491 aa21.86■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.86■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.86■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.86■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.86■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 KIF28PB7ZC32 967 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 SP4Q02446 784 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 DGKDQ16760 1214 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 LRRC26Q2I0M4 334 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 Q4G0T1 1027 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 MOXD1Q6UVY6 613 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 MBOAT7Q96N66 472 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF577Q9BSK1 485 aa21.85■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 ELP1O95163 1332 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 MSH4O15457 936 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 KPNA6O60684 536 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 PPFIA4O75335 1185 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 CABYRO75952 493 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 GPR20Q99678 358 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.84■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 NFASCO94856 1347 aa21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 PSMC6P62333 389 aa21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 PPP4R3AQ6IN85 833 aa21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 SDF4Q9BRK5 362 aa21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTGER3-209ENST00000460330 GRIN2DO15399 1336 aa21.83■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 H3BQV1 296 aa21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 WNT7AO00755 349 aa21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SLC37A4O43826 429 aa21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SNX17Q15036 470 aa21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 KAT2BQ92831 832 aa21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SLC9A2Q9UBY0 812 aa21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ZNF286BP0CG31 522 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 C1orf53Q5VUE5 145 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 MCTP1Q6DN14 999 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 DPF3Q92784 378 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 GJA10Q969M2 543 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 TBC1D22BQ9NU19 505 aa21.81■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 CDK7P50613 346 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 RTP1P59025 263 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ITGA7Q13683 1181 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SEPT1Q8WYJ6 367 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SLC5A5Q92911 643 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ARVCFO00192 962 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 CCNE2O96020 404 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 LGALS2P05162 132 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ATP2B1P20020 1258 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ACTR2P61160 394 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 TRIM60Q495X7 471 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.8■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 F2P00734 622 aa21.79■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 PDCP20941 246 aa21.79■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SYT1P21579 422 aa21.79■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.79■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 RIT2Q99578 217 aa21.79■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 ALPK3Q96L96 1907 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 EVI5O60447 810 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 CHMP4BP1P59074 171 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 TLE2Q04725 743 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 LRCH2Q5VUJ6 765 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 TRIM50Q86XT4 487 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 POTEDQ86YR6 584 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 HAS1Q92839 578 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGER3-209ENST00000460330 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms