RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 RXRAP19793 462 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGFBP4P22692 258 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCND2P30279 289 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADAM17P78536 824 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTK7Q13308 1070 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 NECTIN1Q15223 517 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNKSR3Q6P9H4 555 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERINC5Q86VE9 423 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIBF1Q8WXW3 757 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA33Q96N06 139 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOD1Q9Y239 953 aa9.78□□□□□ -0.84
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERICH2A1L162 156 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 PIK3CDO00329 1044 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TREHO43280 583 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRC1O43663 620 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMARCA1P28370 1054 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRIM50Q86XT4 487 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 C7orf31Q8N865 590 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB2Q96Q27 587 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR20Q99678 358 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTA3Q9BTC8 594 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNPEPQ9H4A4 650 aa9.77□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BRB1 525 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP9AO75110 1047 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJB5O95377 273 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIFRP42702 1097 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TFF2Q03403 129 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GRB10Q13322 594 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SART3Q15020 963 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CREB3L3Q68CJ9 461 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 METTL7BQ6UX53 244 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 DBF4BQ8NFT6 615 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM87BQ96K49 555 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC2Q9BYS8 371 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.76□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 FIBPO43427 364 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TLL1O43897 1013 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LGR5O75473 907 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 STAM2O75886 525 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 PARNO95453 639 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 BMP1P13497 986 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNA2P16389 499 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MCM5P33992 734 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNQ1P51787 676 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 FUT2Q10981 343 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAF1Q13077 416 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF318Q5VUA4 2279 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYO10Q9HD67 2058 aa9.75□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 C17orf102A2RUQ5 167 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01553A4QN01 128 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNFRSF10AO00220 468 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ITGB5P18084 799 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNJ6P48051 423 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERVK-21P61565 698 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 NEDD9Q14511 834 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2SQ16763 222 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GNPTABQ3T906 1256 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 CASC1Q6TDU7 716 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RASEFQ8IZ41 740 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 GDPD5Q8WTR4 605 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 LMBR1Q8WVP7 490 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GAPDHP28-201ENST00000455134 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms