RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452174.5

CERKL-208, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CERKL, Length 1,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-208ENST00000452174 ALG1Q9BT22 464 aa22.18■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.18■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.18■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 MAFGO15525 162 aa22.17■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 KCNA2P16389 499 aa22.17■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 SREBF1P36956 1147 aa22.17■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.17■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 GPR20Q99678 358 aa22.17■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.17■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 DEXIO95424 95 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 SLC34A2O95436 690 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 CSF2RAP15509 400 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 MCTP2Q6DN12 878 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 LRCH3Q96II8 777 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.16■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 PFKFB2O60825 505 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 LGALS2P05162 132 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 NEK4P51957 841 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 CCL23P55773 120 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 ARHGAP4P98171 946 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 SP4Q02446 784 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 C7orf31Q8N865 590 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 NOD1Q9Y239 953 aa22.15■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 PTGISQ16647 500 aa22.14■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 CEP55Q53EZ4 464 aa22.14■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 BICD2Q8TD16 824 aa22.14■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.14■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.14■■□□□ 1.14
CERKL-208ENST00000452174 H3BRB1 525 aa22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 CDKL5O76039 1030 aa22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 NLRP5P59047 1200 aa22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 MEIS1O00470 390 aa22.13■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ARP10275 920 aa22.13■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ZNF76P36508 570 aa22.13■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 CYP3A4P08684 503 aa22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ACRP10323 421 aa22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 SCLYQ96I15 445 aa22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 AIFM3Q96NN9 605 aa22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 IL23AQ9NPF7 189 aa22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 SZT2Q5T011 3432 aa22.12■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 LARGE1O95461 756 aa22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 BFSP2Q13515 415 aa22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ME3Q16798 604 aa22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 TMEM240Q5SV17 173 aa22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 TRIM50Q86XT4 487 aa22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 NFASCO94856 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 STK36Q9NRP7 1315 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 FAM86B1E9PN63 330 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 PITPNM1O00562 1244 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 CTDNEP1O95476 244 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ZNF365Q70YC5 407 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 NECAB1Q8N987 351 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 RETREG2Q8NC44 543 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.1■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 DTNBO60941 627 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 HIC1Q14526 733 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 CAGE1Q8TC20 777 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 GTF3C6Q969F1 213 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 SDF4Q9BRK5 362 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.09■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.08■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.08■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 GPR153Q6NV75 609 aa22.08■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 BLIDQ8IZY5 108 aa22.08■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.08■■□□□ 1.13
CERKL-208ENST00000452174 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms