RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448828.5

NME4-206, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,167 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-206ENST00000448828 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 GPRASP2Q96D09 838 aa26.03■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.03■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 PSMA5P28066 241 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 RABGGTBP53611 331 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 RCAN1P53805 252 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 PTK7Q13308 1070 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 MTMR1Q13613 665 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 TRIM50Q86XT4 487 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 KCNB2Q92953 911 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 VWCEQ96DN2 955 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 CDHR1Q96JP9 859 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 PGBD1Q96JS3 809 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 GPR20Q99678 358 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 USP26Q9BXU7 913 aa26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NME4-206ENST00000448828 C17orf102A2RUQ5 167 aa26.01■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 hCG_1984214I3L0E3 225 aa26.01■■□□□ 1.75
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NME4-206ENST00000448828 RPS6KB1P23443 525 aa26.01■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 FUT2Q10981 343 aa26.01■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.01■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
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NME4-206ENST00000448828 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.01■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 RIC8AQ9NPQ8 531 aa26.01■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 STXBP3O00186 592 aa26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 ITGB5P18084 799 aa26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 ATP6V0A1Q93050 837 aa26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 SENP7Q9BQF6 1050 aa26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 TELO2Q9Y4R8 837 aa26■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 SMCO2A6NFE2 343 aa25.99■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 BARHL2Q9NY43 387 aa25.99■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 THPOP40225 353 aa25.98■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 HIC1Q14526 733 aa25.98■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 WNT8BQ93098 351 aa25.98■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 ANO3Q9BYT9 981 aa25.98■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa25.98■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 ATP9AO75110 1047 aa25.97■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 MYOGP15173 224 aa25.97■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 KCNA2P16389 499 aa25.97■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 KCNJ6P48051 423 aa25.97■■□□□ 1.75
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NME4-206ENST00000448828 TMEM260Q9NX78 707 aa25.97■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.97■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 PPFIA3O75145 1194 aa25.96■■□□□ 1.75
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NME4-206ENST00000448828 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.96■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa25.96■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 COL6A3P12111 3177 aa25.96■■□□□ 1.75
NME4-206ENST00000448828 BAIAP3O94812 1187 aa25.95■■□□□ 1.74
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NME4-206ENST00000448828 AP3B2Q13367 1082 aa25.95■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 SERINC5Q86VE9 423 aa25.95■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.95■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 SETD4Q9NVD3 440 aa25.95■■□□□ 1.74
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NME4-206ENST00000448828 NBNO60934 754 aa25.94■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 MARK3P27448 753 aa25.94■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 ZNF76P36508 570 aa25.94■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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NME4-206ENST00000448828 CNKSR3Q6P9H4 555 aa25.94■■□□□ 1.74
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NME4-206ENST00000448828 CTSHP09668 335 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 RUFY3Q7L099 469 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 SDF4Q9BRK5 362 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.93■■□□□ 1.74
NME4-206ENST00000448828 NID2Q14112 1375 aa25.93■■□□□ 1.74
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