RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445706.5

PACSIN2-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 2, human

TSL 5

Gene PACSIN2, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PACSIN2-208	ENST00000445706	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	CHD6	Q8TD26	2715 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	RLBP1	P12271	317 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	PPTC7	Q8NI37	304 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	SUSD6	Q92537	303 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	GPAA1	O43292	621 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	APP	P05067	770 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	APBB2	Q92870	758 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	P2RX5	Q93086	422 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	KAT6A	Q92794	2004 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	ITGB1	P05556	798 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	HOXC8	P31273	242 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	LAMC2	Q13753	1193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZBTB33	Q86T24	672 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	APPBP2	Q92624	585 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706		M0R2C6	588 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	TREH	O43280	583 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	CAND2	O75155	1236 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	GNAT2	P19087	354 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	TSPY2	A6NKD2	308 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	PPFIA4	O75335	1185 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	BRD1	O95696	1058 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	NOV	P48745	357 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	PPARA	Q07869	468 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	STXBP2	Q15833	593 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	POF1B	Q8WVV4	589 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SORBS3	O60504	671 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	DGKI	O75912	1065 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	USH1G	Q495M9	461 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	IWS1	Q96ST2	819 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	TLE6	Q9H808	572 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	PER2	O15055	1255 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	SPATA33	Q96N06	139 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	RMDN3	Q96TC7	470 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	USP24	Q9UPU5	2620 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PACSIN2-208	ENST00000445706	ENPP3	O14638	875 aa		13.72	□□□□□ -0.21

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