RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440048.1

VARS-217, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VARS, Length 804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-217ENST00000440048 MFSD10Q14728 455 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 MCTP2Q6DN12 878 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 GPR20Q99678 358 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 ALG1Q9BT22 464 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 KATNAL1Q9BW62 490 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 HIPK3Q9H422 1215 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 TELO2Q9Y4R8 837 aa27■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 HAS3O00219 553 aa26.99■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 MAFGO15525 162 aa26.99■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 CDKL5O76039 1030 aa26.99■■□□□ 1.91
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VARS-217ENST00000440048 KIAA0753Q2KHM9 967 aa26.99■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 SESTD1Q86VW0 696 aa26.99■■□□□ 1.91
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VARS-217ENST00000440048 C16orf70Q9BSU1 422 aa26.99■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 PKD2L1Q9P0L9 805 aa26.99■■□□□ 1.91
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VARS-217ENST00000440048 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
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VARS-217ENST00000440048 CYP2C9P11712 490 aa26.98■■□□□ 1.91
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VARS-217ENST00000440048 SHHQ15465 462 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 ME3Q16798 604 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 CEP55Q53EZ4 464 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 C9orf50Q5SZB4 431 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 RASGRP4Q8TDF6 673 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 CRYGNQ8WXF5 182 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 AIFM3Q96NN9 605 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 KCNH7Q9NS40 1196 aa26.98■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 LGALS2P05162 132 aa26.97■■□□□ 1.91
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VARS-217ENST00000440048 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.97■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 MEIS1O00470 390 aa26.96■■□□□ 1.91
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VARS-217ENST00000440048 CTDNEP1O95476 244 aa26.96■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 CYP3A4P08684 503 aa26.96■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 ARP10275 920 aa26.96■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 ZNF76P36508 570 aa26.96■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 C7orf31Q8N865 590 aa26.96■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 STK36Q9NRP7 1315 aa26.95■■□□□ 1.91
VARS-217ENST00000440048 CSF2RAP15509 400 aa26.95■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.95■■□□□ 1.92e-11■■■□□ 16.5
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VARS-217ENST00000440048 GTF3C6Q969F1 213 aa26.95■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 LRCH3Q96II8 777 aa26.95■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 KIF2CQ99661 725 aa26.95■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.95■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 WNT8AQ9H1J5 351 aa26.95■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26.95■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 NOD1Q9Y239 953 aa26.95■■□□□ 1.9
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VARS-217ENST00000440048 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 PCDHA4Q9UN74 947 aa26.94■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 FAM86B1E9PN63 330 aa26.93■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 FAM86B2P0C5J1 330 aa26.93■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 TRIM50Q86XT4 487 aa26.93■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa26.92■■□□□ 1.9
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VARS-217ENST00000440048 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
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VARS-217ENST00000440048 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.92■■□□□ 1.9
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VARS-217ENST00000440048 NFASCO94856 1347 aa26.91■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 GALNT17Q6IS24 598 aa26.91■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 DAGLBQ8NCG7 672 aa26.91■■□□□ 1.9
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VARS-217ENST00000440048 M0R2N6 131 aa26.9■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 ACRP10323 421 aa26.9■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 HIC1Q14526 733 aa26.9■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.9■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 SCN5AQ14524 2016 aa26.9■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 KAT6AQ92794 2004 aa26.89■■□□□ 1.9
VARS-217ENST00000440048 PITPNM1O00562 1244 aa26.89■■□□□ 1.9
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