RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PBX4Q9BYU1 374 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 EVPLQ92817 2033 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PPFIA4O75335 1185 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ADCY7P51828 1080 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 NEDD9Q14511 834 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 RETREG2Q8NC44 543 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 MYLIPQ8WY64 445 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PHKBQ93100 1093 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 USP26Q9BXU7 913 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 NID2Q14112 1375 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SMCO2A6NFE2 343 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PITPNM1O00562 1244 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 KCNA2P16389 499 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 RABGGTBP53611 331 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 RCAN1P53805 252 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 BFSP2Q13515 415 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 NLRX1Q86UT6 975 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TIFAQ96CG3 184 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 GPRASP2Q96D09 838 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ANO3Q9BYT9 981 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 BARHL2Q9NY43 387 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 H3BRB1 525 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PSMA5P28066 241 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 MTMR1Q13613 665 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 GPNMBQ14956 572 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 GRIN2CQ14957 1233 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PKN1Q16512 942 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 XRRA1Q6P2D8 792 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 RUFY3Q7L099 469 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CKBP12277 381 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SCG2P13521 617 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 MYOGP15173 224 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 NTRK3Q16288 839 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TCTN1Q2MV58 587 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CAGE1Q8TC20 777 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 UIMC1Q96RL1 719 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ZNF576Q9H609 170 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 CHD7Q9P2D1 2997 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.13
PRAME-209ENST00000439106 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 TREHO43280 583 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 NBNO60934 754 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 SELPP16109 830 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 STK3Q13188 491 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 PTK7Q13308 1070 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 AFAP1L1Q8TED9 768 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 EHMT1Q9H9B1 1298 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 JADE2Q9NQC1 790 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 DTNBO60941 627 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 PFKMP08237 780 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 ARP10275 920 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 MARK3P27448 753 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-209ENST00000439106 RFC2P35250 354 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms