RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa32.13■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 GPR20Q99678 358 aa32.13■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 H3BRB1 525 aa32.12■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 CXCL10P02778 98 aa32.12■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 NEDD9Q14511 834 aa32.12■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 MBTPS1Q14703 1052 aa32.12■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 VCANP13611 3396 aa32.11■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF618Q5T7W0 954 aa32.11■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 TYW1BQ6NUM6 668 aa32.11■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNB2Q92953 911 aa32.11■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 SENP7Q9BQF6 1050 aa32.11■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ITGB5P18084 799 aa32.1■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 WWC2Q6AWC2 1192 aa32.1■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa32.1■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 SERINC5Q86VE9 423 aa32.1■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 SLC9A7Q96T83 725 aa32.1■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 PTPRSQ13332 1948 aa32.09■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP9AO75110 1047 aa32.09■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ARHGEF15O94989 841 aa32.09■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa32.09■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa32.09■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 TRIM50Q86XT4 487 aa32.09■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa32.09■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 NOP56O00567 594 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 BAIAP3O94812 1187 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 CPA1P15085 419 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 PPP2R2DQ66LE6 453 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 HERC6Q8IVU3 1022 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 USP26Q9BXU7 913 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 RNPEPQ9H4A4 650 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa32.08■■■□□ 2.73
TRIOBP-209ENST00000428075 ZBTB43O43298 467 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 CA3P07451 260 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNA2P16389 499 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 RTN1Q16799 776 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 GPRASP2Q96D09 838 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 CCDC136Q96JN2 1154 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 PCDHA6Q9UN73 950 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa32.07■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 TRANK1O15050 2925 aa32.06■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 PARNO95453 639 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 CDC27P30260 824 aa32.06■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR5P61964 334 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 KRT32Q14532 448 aa32.06■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 NLRX1Q86UT6 975 aa32.06■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 PRDM6Q9NQX0 595 aa32.06■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 C17orf102A2RUQ5 167 aa32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 TREHO43280 583 aa32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 SP4Q02446 784 aa32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 CNKSR3Q6P9H4 555 aa32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP6V0A1Q93050 837 aa32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 V9GY48 417 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 DEFB103AP81534 67 aa32.04■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP32.04■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 GOLGA8AA7E2F4 631 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 GOLGA8BA8MQT2 603 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 HSPA4P34932 840 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 ADAM17P78536 824 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 OSBPL7Q9BZF2 842 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 RIC8AQ9NPQ8 531 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 SETD4Q9NVD3 440 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 SNX14Q9Y5W7 946 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 REV3LO60673 3130 aa32.03■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 EPOPA6NHQ4 379 aa32.02■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 SPDYE3A6NKU9 549 aa32.02■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 STXBP3O00186 592 aa32.02■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 THPOP40225 353 aa32.02■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 TAP1Q03518 808 aa32.02■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 JADE2Q9NQC1 790 aa32.02■■■□□ 2.72
TRIOBP-209ENST00000428075 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 RFXAPO00287 272 aa32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 IGFBP4P22692 258 aa32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 SPRED2Q7Z698 418 aa32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 PPM1EQ8WY54 764 aa32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 PGBD1Q96JS3 809 aa32.01■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 ADD1P35611 737 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 KCNJ6P48051 423 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 RCAN1P53805 252 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 NAPAP54920 295 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 APOBRQ0VD83 1088 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 MTMR1Q13613 665 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 CYP2W1Q8TAV3 490 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 CDHR1Q96JP9 859 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 CERS4Q9HA82 394 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 PKD2L1Q9P0L9 805 aa32■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa31.99■■■□□ 2.71
TRIOBP-209ENST00000428075 LCHNA4D1U4 455 aa31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms