RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 TAP1Q03518 808 aa24.17■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF618Q5T7W0 954 aa24.17■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.17■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 GPR20Q99678 358 aa24.17■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.17■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf102A2RUQ5 167 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 CAND2O75155 1236 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 RNF20Q5VTR2 975 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 PPM1EQ8WY54 764 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 BCAS3Q9H6U6 928 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 PRDM6Q9NQX0 595 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 MYO9BQ13459 2157 aa24.16■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 TLL1O43897 1013 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 MBTPS1Q14703 1052 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 CYFIP1Q7L576 1253 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 NLRX1Q86UT6 975 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 GPRASP2Q96D09 838 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 RTEL1Q9NZ71 1219 aa24.15■■□□□ 1.46
LIMS1-208ENST00000428064 RXRAP19793 462 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 IKBKEQ14164 716 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TEX2Q8IWB9 1127 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 FANCBQ8NB91 859 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 CDHR1Q96JP9 859 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ASB2Q96Q27 587 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 LGR5O75473 907 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF15O94989 841 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 GJB5O95377 273 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB103AP81534 67 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TCTN1Q2MV58 587 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.13■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 RSPH10BP0C881 870 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 GNAT1P11488 350 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 THPOP40225 353 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 EPOPA6NHQ4 379 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TREHO43280 583 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 APOA5Q6Q788 366 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 MICU3Q86XE3 530 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 NEK1Q96PY6 1258 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 RAD9AQ99638 391 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 KCNA2P16389 499 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ADAM17P78536 824 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ZBED2Q9BTP6 218 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 CERS4Q9HA82 394 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa24.1■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 COL4A6Q14031 1691 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 LCHNA4D1U4 455 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 RFXAPO00287 272 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 MAFGO15525 162 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 ITGB5P18084 799 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM50Q86XT4 487 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 NRCAMQ92823 1304 aa24.09■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 SIP14410 1827 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R18Q6NYC8 613 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.08■■□□□ 1.45
LIMS1-208ENST00000428064 TTC28Q96AY4 2481 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 hCG_1984214I3L0E3 225 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 ATP9AO75110 1047 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 RCAN1P53805 252 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 MTMR1Q13613 665 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 KRT32Q14532 448 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2SQ16763 222 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 FAM26DQ5JW98 314 aa24.07■■□□□ 1.44
LIMS1-208ENST00000428064 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.07■■□□□ 1.44
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