RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 JADE2Q9NQC1 790 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 IFNKQ9P0W0 207 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 STK24Q9Y6E0 443 aa23.45■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 PSMC6P62333 389 aa23.44■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 DDX12PQ92771 950 aa23.44■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.44■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ACAD9Q9H845 621 aa23.44■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.44■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.44■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.43■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 PDE4DQ08499 809 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 STK4Q13043 487 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 UNC13DQ70J99 1090 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 RIT2Q99578 217 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.43■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 GAS7O60861 476 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 SLC12A3P55017 1021 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 PLS1Q14651 629 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 DYMQ7RTS9 669 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 MAF1Q9H063 256 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.43■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 COBLO75128 1261 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 OFD1O75665 1012 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 FCER1AP12319 257 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ARHGEF16Q5VV41 709 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 MB21D1Q8N884 522 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 EXOC1Q9NV70 894 aa23.42■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 CNMDO75829 334 aa23.41■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 SLITRK3O94933 977 aa23.41■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 CYP4A11Q02928 519 aa23.41■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 PAK1Q13153 545 aa23.41■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.41■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.41■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.41■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 HPS3Q969F9 1004 aa23.41■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 COBLL1Q53SF7 1204 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 ARSHQ5FYA8 562 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 CHST13Q8NET6 341 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 CHMP2AO43633 222 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 HERVK_113P62684 666 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 MTMR1Q13613 665 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 CST9Q5W186 159 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.4■■□□□ 1.34
GPC1-202ENST00000420138 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.4■■□□□ 1.34
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GPC1-202ENST00000420138 SNAPC2Q13487 334 aa23.39■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
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GPC1-202ENST00000420138 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.38■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 KCNF1Q9H3M0 494 aa23.38■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
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GPC1-202ENST00000420138 SERPINC1P01008 464 aa23.38■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
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GPC1-202ENST00000420138 UBASH3AP57075 661 aa23.38■■□□□ 1.33
GPC1-202ENST00000420138 GPBP1Q86WP2 473 aa23.38■■□□□ 1.33
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