RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO41Q8TF61 875 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 GJA10Q969M2 543 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ESYT2A0FGR8 921 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNI2P48788 182 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC63Q05C16 580 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT79Q5XKE5 535 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.94e-13■■■■■ 47.6
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC181Q5TID7 509 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 STYK1Q6J9G0 422 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 BUB1O43683 1085 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 LCA5LO95447 670 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 SMARCA1P28370 1054 aa20.65■□□□□ 0.9
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SH3BP1-202ENST00000417536 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TEKT1Q969V4 418 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB34Q9BZG1 259 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 AKR1B1P15121 316 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2SQ16763 222 aa20.64■□□□□ 0.9
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SH3BP1-202ENST00000417536 TSG101Q99816 390 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.64■□□□□ 0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 ECM1Q16610 540 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PDXDC1Q6P996 788 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 CNKSR1Q969H4 720 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC1A4P43007 532 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 DACT2Q5SW24 774 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR8Q96EF0 704 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNMA1Q12791 1236 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCB11O95342 1321 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PRLRP16471 622 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PDIA5Q14554 519 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAF5O00463 557 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SLF2Q8IX21 1173 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.62■□□□□ 0.89
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SH3BP1-202ENST00000417536 PLCG2P16885 1265 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PODNQ7Z5L7 613 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 CERS3Q8IU89 383 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM76AQ8TAV0 307 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 CLRN2A0PK11 232 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 DNA2P51530 1060 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 EHHADHQ08426 723 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 COASYQ13057 564 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 HGSNATQ68CP4 663 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A14Q96JA4 679 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TLR10Q9BXR5 811 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PAFAH1B1P43034 410 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ITIH3Q06033 890 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PJA2O43164 708 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNA3P22001 575 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 APBA1Q02410 837 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMD2Q13200 908 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 TTLL6Q8N841 843 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 NOX5Q96PH1 765 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 COL4A5P29400 1685 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC20A2Q08357 652 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.6■□□□□ 0.89
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