RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH7Q9NS40 1196 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 MEIS1O00470 390 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 DTNBO60941 627 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD10Q14728 455 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD5Q6N075 450 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 RASGRP4Q8TDF6 673 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf70Q9BSU1 422 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 PKD2L1Q9P0L9 805 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 TELO2Q9Y4R8 837 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 HAS3O00219 553 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LARGE1O95461 756 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 F2P00734 622 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP3A4P08684 503 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ARP10275 920 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SP4Q02446 784 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SESTD1Q86VW0 696 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf31Q8N865 590 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 HIPK3Q9H422 1215 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2C9P11712 490 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2C18P33260 490 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FPGSQ05932 587 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF3C6Q969F1 213 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 HDAC6Q9UBN7 1215 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 H3BRB1 525 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 LGALS2P05162 132 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PTGISQ16647 500 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GALNT17Q6IS24 598 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 NIPA1Q7RTP0 329 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM199Q8N511 208 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 STK36Q9NRP7 1315 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM86B1E9PN63 330 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM86B2P0C5J1 330 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 EPHB4P54760 987 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SHHQ15465 462 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PLA2G4DQ86XP0 818 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 BLIDQ8IZY5 108 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNJ14Q9UNX9 436 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 NOD1Q9Y239 953 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 FDPSP14324 419 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CSF2RAP15509 400 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 XBP1P17861 261 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 WASF1Q92558 559 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 SDF4Q9BRK5 362 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 UMODL1Q5DID0 1318 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL23P55773 120 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.442e-11■■□□□ 11.4
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf50Q5SZB4 431 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R2N6 131 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 EDIL3O43854 480 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 CIITAP33076 1130 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 USP11P51784 963 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 NPY5RQ15761 445 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 LRIT3Q3SXY7 679 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 GJB4Q9NTQ9 266 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC9A2Q9UBY0 812 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 NFASCO94856 1347 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf59Q7L2K0 433 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM50Q86XT4 487 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RETREG2Q8NC44 543 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TBCKQ8TEA7 893 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 CTAGE1Q96RT6 745 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 WNT8AQ9H1J5 351 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 HIC1Q14526 733 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR16Q569H4 304 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 UIMC1Q96RL1 719 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.98■■□□□ 1.43
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