RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TDHQ8IZJ6 230 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM199Q8N511 208 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAGE1Q8TC20 777 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COPS5Q92905 334 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MXRA8Q9BRK3 442 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SDF4Q9BRK5 362 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRMS1Q9HCU9 246 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDHA4Q9UN74 947 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HAS3O00219 553 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MEIS1O00470 390 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAND2O75155 1236 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC24BO95487 1268 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNAT1P11488 350 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYN1P17600 705 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITGB5P18084 799 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CIITAP33076 1130 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RFC2P35250 354 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF76P36508 570 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MCM2P49736 904 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC26A2P50443 739 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP11P51784 963 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NLRP5P59047 1200 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FPGSQ05932 587 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBL2Q08999 1139 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK3Q13188 491 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEMA3FQ13275 785 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BFSP2Q13515 415 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRIT3Q3SXY7 679 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MFSD5Q6N075 450 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR153Q6NV75 609 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C7orf31Q8N865 590 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIPK3Q9H422 1215 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOD1Q9Y239 953 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DOCK5Q9H7D0 1870 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRIN2DO15399 1336 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EMSYQ7Z589 1322 aa9.76□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H3BRB1 525 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LGALS2P05162 132 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSEN2P49810 448 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SP2Q02086 613 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MFSD10Q14728 455 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM47CQ5HY64 1035 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYFIP1Q7L576 1253 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BLIDQ8IZY5 108 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KAT2BQ92831 832 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR20Q99678 358 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF3AQ9Y496 699 aa9.75□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 B4GALT4O60513 344 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXC8P31273 242 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMC6P62333 389 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT76Q01546 638 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTK7Q13308 1070 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM29Q14134 588 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ME3Q16798 604 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLA2G4DQ86XP0 818 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AFAP1L1Q8TED9 768 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BADQ92934 168 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C16orf70Q9BSU1 422 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AZI2Q9H6S1 392 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERAP1Q9NZ08 941 aa9.74□□□□□ -0.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms