RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404321.3

PTPRN2-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRN2, Length 1,374 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-204ENST00000404321 LGALS2P05162 132 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 KCNA2P16389 499 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.911e-6■■□□□ 12.4
PTPRN2-204ENST00000404321 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 TRIM50Q86XT4 487 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.914e-6■□□□□ 11.2
PTPRN2-204ENST00000404321 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SZT2Q5T011 3432 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ESYT2A0FGR8 921 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SCRN1Q12765 414 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 CDHR1Q96JP9 859 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 AIFM3Q96NN9 605 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 MXRA8Q9BRK3 442 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.75■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 HAS3O00219 553 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF76P36508 570 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SREBF1P36956 1147 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ARHGAP4P98171 946 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 C8orf34Q49A92 452 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF365Q70YC5 407 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 UIMC1Q96RL1 719 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 H3BRB1 525 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ARP10275 920 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 GNA11P29992 359 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 NEK4P51957 841 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 NLRP5P59047 1200 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 HIC1Q14526 733 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SESTD1Q86VW0 696 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 ANKRD1Q15327 319 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 CEP55Q53EZ4 464 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 TMEM240Q5SV17 173 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 Q7L0L9 218 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 NECAB1Q8N987 351 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 IL23AQ9NPF7 189 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 PFKFB2O60825 505 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 DEXIO95424 95 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 LARGE1O95461 756 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 RETREG2Q8NC44 543 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 IL17RAQ96F46 866 aa20.72■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM86B1E9PN63 330 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 BICD2Q8TD16 824 aa20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRN2-204ENST00000404321 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 MEIS1O00470 390 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 MAFGO15525 162 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 CDKL5O76039 1030 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 BFSP2Q13515 415 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 ME3Q16798 604 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 PLA2G4DQ86XP0 818 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 SEPT1Q8WYJ6 367 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 WNT8BQ93098 351 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 SDF4Q9BRK5 362 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 CTDNEP1O95476 244 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 FGBP02675 491 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 IQCF3P0C7M6 154 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 MARK3P27448 753 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 VWCEQ96DN2 955 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 KCNJ14Q9UNX9 436 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 PITPNM1O00562 1244 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 CYP3A4P08684 503 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRN2-204ENST00000404321 MCTP2Q6DN12 878 aa20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms