RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395560.7

UPP1-202, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 955 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-202ENST00000395560 MRVI1Q9Y6F6 885 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 NFASCO94856 1347 aa20.17■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 NEDD9Q14511 834 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 CCL14Q16627 93 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 TAPT1Q6NXT6 567 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 SDF4Q9BRK5 362 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.16■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 GAS7O60861 476 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 PSMD10O75832 226 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 KCNA2P16389 499 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 MCM4P33991 863 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 SEMA3FQ13275 785 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 TRIB2Q92519 343 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 MCM3APO60318 1980 aa20.15■□□□□ 0.82
UPP1-202ENST00000395560 A0A1W2PQ27 194 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 A0A1W2PQ64 194 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 A0A1W2PQD8 194 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ADCY3O60266 1144 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CYP2C19P33261 490 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 TECP42680 631 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 KRT76Q01546 638 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 PPP2R5CQ13362 524 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CCDC62Q6P9F0 684 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ATP9AO75110 1047 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 HMGCRP04035 888 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 UBE2HP62256 183 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 IL17AQ16552 155 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CSRNP2Q9H175 543 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 VAV3Q9UKW4 847 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.13■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 SLC26A4O43511 780 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CMA1P23946 247 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 SFNP31947 248 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 RDM1Q8NG50 284 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ERMNQ8TAM6 284 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ARMC5Q96C12 935 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 PDGFCQ9NRA1 345 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.12■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 TXLNAP40222 546 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 SP2Q02086 613 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 METTL7BQ6UX53 244 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CLIC6Q96NY7 704 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 LMBRD1Q9NUN5 540 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 SLC9A2Q9UBY0 812 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 Q9Y3F1 56 aa20.11■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ARIH2O95376 493 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CYBAP13498 195 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 AKR1A1P14550 325 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 GRK4P32298 578 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 UBA7P41226 1012 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 JAK3P52333 1124 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 TNFAIP2Q03169 654 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 LAMC2Q13753 1193 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 LY6KQ17RY6 165 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 RESP18Q5W5W9 173 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 KRT79Q5XKE5 535 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 NEK9Q8TD19 979 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 GJA10Q969M2 543 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.1■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 WDR64B1ANS9 1081 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 GGPS1O95749 300 aa20.09■□□□□ 0.81
UPP1-202ENST00000395560 GH1P01241 217 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms