RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR20Q99678 358 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PDRG1Q9NUG6 133 aa23.16■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP9AO75110 1047 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 BFSP2Q13515 415 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR1Q13613 665 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 RETREG2Q8NC44 543 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 JADE2Q9NQC1 790 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 TELO2Q9Y4R8 837 aa23.15■■□□□ 1.3
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BRB1 525 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 PITPNM1O00562 1244 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 FGBP02675 491 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNA2P16389 499 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 IFNAR1P17181 557 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 AP3B2Q13367 1082 aa23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 SZT2Q5T011 3432 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ESYT2A0FGR8 921 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 RASIP1Q5U651 963 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC155Q8N6L0 562 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 HERVK_113Q902F9 699 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 C6orf50Q9HD87 102 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 IQCF3P0C7M6 154 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 SREBF1P36956 1147 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM50Q86XT4 487 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP2W1Q8TAV3 490 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CAGE1Q8TC20 777 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 VWCEQ96DN2 955 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CPLX1O14810 134 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS3O15072 1205 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 MAFGO15525 162 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ANAPC15P60006 121 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 STK3Q13188 491 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 HIC1Q14526 733 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM161BQ96MY7 647 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 PFKMP08237 780 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 RFC2P35250 354 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP4P98171 946 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CEP55Q53EZ4 464 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ARP10275 920 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 GNA11P29992 359 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF76P36508 570 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 PTK7Q13308 1070 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 KAT6AQ92794 2004 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 GRXCR1A8MXD5 290 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 SELPP16109 830 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 RBL2Q08999 1139 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 WNT8BQ93098 351 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ANKRD39-201ENST00000393537 TET1Q8NFU7 2136 aa23.08■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBBXA8MT70 800 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 MEIS1O00470 390 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 CKBP12277 381 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 MCTP2Q6DN12 878 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 BICD2Q8TD16 824 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.07■■□□□ 1.28
ANKRD39-201ENST00000393537 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms